本文考察了中共南京地下党与建政初期南京市第一次整党运动的历史。抗战胜利后,南京地下党重建机构和发展组织,展开迎接新政权建立的地下斗争。1949年4月,中华民国首都南京为中共南下大军和地下党共同接管。双方既互相配合,也因对人事分配、接管政策的分歧以及工作、生活习惯和待遇等方面的差异,产生矛盾。原南京地下党市委书记陈修良在南下党和地下党的矛盾和冲突中首当其冲。中央高层实际上依靠南下大军管理新区城市,南下干部在新的党政机构居于主导地位。作为矛盾一方的南京地下党受到怀疑和责难。华东局及南下干部认定南京地下党在1948年末到1949年初的大发展,导致其“组织不纯”。在华东局的指示下,由外来干部主导的南京市委展开了一场针对地下党的整党运动。这是中共建政初期新区第一次地方性整党,也是专门针对地下党的一轮政治运动,反映出新区城市地下党与南下党之间关系的某些特点。