变形杆菌整合子分型及质粒介导的喹诺酮耐药机制研究

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研究背景变形杆菌是临床上重要的病原菌,包括4个种:普通变形杆菌(P.vulgaris)、奇异变形杆菌、产粘变形杆菌和潘氏变形杆菌,其中奇异变形杆菌是易引起尿路感染且难以治愈的一种病原菌。抗生素的过度使用和误用造成了细菌多重耐药菌株的出现。最近几年,有着可移动DNA元件的新系统—整合子被提出。整合子由特殊的结构组成:两端保守区域框定了一个含有中间未知的开放读码框或“基因盒”,这些基因编码了特定的抗生素耐药。通过整合子的整合作用,抗性基因之间能够互相交换。整合子已被证实了多重耐药的获得和水平传播起着重要作用。喹诺酮类药物是第一个完全人工合成的抗菌药物,被广泛应用于各种类型临床感染的治疗。随着喹诺酮类药物的应用,变形杆菌对喹诺酮类药物敏感性下降或耐药的临床分离株在不断增多。变形杆菌对喹诺酮类的耐药机制非常复杂,迄今为止,喹诺酮类的耐药机制主要有两个方面:药物作用靶位点的改变和菌体内药物浓度的降低,后者又可以由细胞外膜孔道蛋白的丢失和外排泵系统的表达引起。这两类耐药机制都是由染色体基因突变引起,不具有水平传播性。1998年Martinez-Martinez等发现在一株临床分离的肺炎克雷伯菌中一个低水平的喹诺酮耐药可通过质粒所转移,该基因被命名为喹诺酮类药物耐药基因qnr,其作用机制是保护喹诺酮类药物靶位点DNA解旋酶和/或拓扑异构酶Ⅳ。使喹诺酮类药物不易与其结合,从而导致药物治疗失败。对该基因结构分析表明,它一般位于Ⅰ类整合子,常与其他耐药基因共存,最常见的是ESBLs基因。qnr基因在世界各地如东亚、美洲、欧洲等地相继被分离,越来越引起广泛关注,随后,两个新的Qnr同族体QnrB和QnrS相继被报道,原qnr基因命名为qnrA。目前国内关于变形杆菌携带qnr基因尚未有报道,我们对来自安徽细菌耐药中心(2004年10月~2006年10月)安徽省细菌耐药监控41家网络医院分离的146株变形杆菌进行了耐药性及其1、2类整合子基因和qnr基因的检测。目的了解临床分离变形杆菌中1、2类整合子的流行现状以及其耐药性。研究临床分离变形杆菌质粒介导的喹酮类耐药基因(qnr基因)存在情况。材料与方法收集2004年10月至2006年10月安徽省细菌耐药监控41家网络医院分离的146株变形杆菌。PCR扩增146株变形杆菌中1、2类整合酶基因,M-H肉汤微量稀释法检测146株变形杆菌的药敏情况。用聚合酶链反应(PCR)对146株变形杆菌细菌进行qnr基因检测。药敏检测采用M-H肉汤微量稀释法。碱裂解法提取质粒,氯化钙法制备感受态细胞。结果1类整合子检出率36.9%(54/146),2类整合子检出率38.4%(56/146),同时携带1、2类整合子的检出率18.5%(27/146)。146株变形杆菌中有3株检测出qnr基因:分别为qnrA、qnrB2、qnrS1,其中有1株同时携带qnrB2和qnrS1。qnrB2在第259位碱基发生C→A(精氨酸→丝氨酸)突变,三种qnr基因序列已在基因库注册,授权号:EF488761,EF488762,EF501989。3株qnr基因阳性株中2株为产ESBLs菌株。结论1、2类整合子在变形杆菌感染临床分离株中所占比例分别为36.9%和38.4%。1、2类整合子与变形杆菌的多重耐药具有相关性。qnr基因在变形杆菌中的携带率较低。几种qnr基因单独作用对喹诺酮类抗菌药物靶位点的保护相对较弱。
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