白唇鹿(white-lipped deer or Thorolds deer，Cervus albirostris)栖息在海拔3500m-5100m的高山针叶林、灌丛和高山草甸，是青藏高原特有的鹿类。由于繁殖率低，偷猎和栖息地破碎化等原因，白唇鹿的分布范围较历史时期缩减，被列为我国一级保护动物，IUCN濒危物种红色名录“易危(UV)”级物种，中国脊椎动物红色名录“濒危(EN)”级物种。近年来，系统进化研究认为白唇鹿与梅花鹿(Cervus nippon)和美洲马鹿(C.canadensis)的亲缘关系较近，但三者的系统发育和分化历史并不清楚，白唇鹿谱系地理结构和系统进化地位等问题也亟待解答。　　为验证白唇鹿种群遗传差异和分化，探讨白唇鹿的系统进化历史，本研究采用白唇鹿线粒体细胞色素b(Cyt b)和控制区(CR)序列分析了其种群遗传结构和种群历史动态，并探讨了白唇鹿与梅花鹿、马鹿的系统进化关系。　　系统发育树和单倍型网络图均显示，白唇鹿可分为两个支系，支系A为工布江达种群，而支系B包含所有其他地区的白唇鹿。种群历史动态分析推断白唇鹿在末次冰期出现轻微的种群扩张状况。　　研究结果表明，白唇鹿和梅花鹿、美洲马鹿构成单系类群，与之前的研究结果一致。白唇鹿与梅花鹿和美洲马鹿的分化时间为3.32Ma(95％置信区间:2.25-5.01)，恰好与青藏高原隆升的时间相吻合。白唇鹿是随着青藏高原隆起而分化，并在其进化过程中适应了高原环境的特有鹿类。而梅花鹿和美洲马鹿的分化则可能与青藏高原隆升和第四纪冰期共同作用的气候变化有关。　　用最大熵值模型(MaxEnt)预测白唇鹿潜在分布区主要集中在横断山脉地区，雅鲁藏布江、唐古拉山和祁连山脉。其中，海拔和夏季植被归一化指数对白唇鹿分布区预测的贡献值最大。　　综上所述，白唇鹿是随着青藏高原隆起而进化，并且高度适应高寒环境的物种。本文检测到白唇鹿具有遗传结构分化，且在末次冰期后出现轻微种群扩张趋势，但本研究样本量有限，未来应尽可能采集更多的样品，以判断不同种群间是否存在明显的遗传分化，为物种保护划分合理的管理单元。白唇鹿的栖息生境局限于青藏高原的几大山系之间，应注意避免人为因素造成隔离。