本文在介绍公司治理理论和我国商业银行公司治理特殊性以及新颁布的关于商业银行内部控制目标基础上,对我国上市商业银行的公司治理结构状况和内部控制状况进行分析,总结了国内外学者的研究成果,选取2005-2010年上市商业银行的相关数据,从产权结构、资本结构、制衡机制(即股东大会—董事会—经理—监事会相互监督和制衡)和激励机制等方面研究对内部控制有效性,即资产的盈利能力、资产的质量和资产的流动性方面的影响,提出研究假设,建立多元回归模型对理论假设进行验证,并针对研究结果提出提高商业银行内部控制有效性的建议。研究得出:(1)与资产盈利能力呈显著正相关的有董事会规模、董事和行长两职合一、职工监事规模、反激励机制的前三名高管薪酬;与资产盈利能力显著负相关的有反应股权集中度的前三大股东持股比例之和、独立董事规模和监事会规模;股权制衡度、反应资产结构的财务杠杆与资产盈利能力呈正相关,但相关性不显著;董事会和监事会会议与资产盈利能力呈负相关。(2)与反映资产质量的不良贷款率呈显著的正相关的有股权集中度、独立董事规模、和财务杠杆;与不良贷款率显著负相关的有董事会规模、监事会规模、董事会和监事会会议,职工监事规模与不良贷款率也呈负相关,但相关性不显著;董事会两职合一、前三名高管薪酬和股权制衡度与不良贷款率呈不显著的正相关关系。(3)与资产流动性显著正相关的有董事会规模、前三名高管薪酬、财务杠杆;与资产流动性显著负相关的有独立董事规模、监事会规模和职工监事规模;股权集中度、股权制衡度、董事两职合一、董事会和监事会会议与资产流动性的相关关系均不显著。