小熊猫是我国二级保护动物,具有独特的生态学价值和观赏价值,许多动物园都引进饲养,随着圈养数量的增加,疾病引起的死亡报道也不断增加。致病性大肠杆菌是临床最常见的病原菌之一,由于致病性大肠杆菌分型复杂,临床动物感染大肠杆菌病病理表现各异,主要以肠道病变为主。临床兽医仅通过发病特征往往不能准确判定病因,确诊需要进行实验室相关诊断。2018年4月本实验室从成都大熊猫繁育研究基地获得一死亡小熊猫组织样品,通过病理组织学及细菌学方法对其进行病因诊断,综合诊断为该小熊猫因感染致病性大肠杆菌引发败血症导致多系统衰竭致死。对分离所得菌株进行常规分离鉴定,16SrDNA序列分析鉴定、耐药性试验、小鼠攻毒试验、以及细菌全基因组的检测等相关试验,结果为:1.在普通琼脂培养基上菌落呈圆形灰白色,微凸,在麦康凯平板上菌落成红色,单个菌落直径约为1²mm,在显微镜下多为单个分布的短杆状革兰氏阴性菌且无芽孢,长约1³μm。2.分离菌株16SrDNA序列测定结果与NCBI细菌基因库比对,与已有大肠杆菌序列重合度达99%以上。3.对18种抗生素药敏试验结果显示该细菌对氨苄西林和头孢呋辛耐药,对头孢唑啉中度敏感,对其他抗生素高度敏感。4.小鼠攻毒试验得出半数致死量LD₅₀=6.5×10⁷ CFU/mL,攻毒小鼠病理组织学变化主要表现为出血性肠炎与死亡大熊猫的肠道病理组织变化吻合。5.全基因测序结果显示该分离菌株与大肠杆菌高度同源,检测出耐药基因21个,毒力基因713个。综上,通过病理学诊断与细菌学鉴定相结合确诊该小熊猫为致病性大肠杆菌感染致死;通过对分离菌株开展耐药性试验,可为小熊猫大肠杆菌病的临床用药选择提供参考,小鼠攻毒试验有利于把握该菌株的致病力;全基因测序技术在基因水平揭示该大肠杆菌遗传特性,将小熊猫大肠杆菌病致病机理的研究深入到基因水平,为未来相关疫苗研发提供基础资料。