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目的： 编码I型钠通道α亚基(Nav1.1)的SCN1A基因突变与热性惊厥相关性癫痫关系最为密切。其中截短突变或错义突变导致蛋白功能异常的研究相对较多，而剪切位点突变所造成的影响研究甚少。本研究通过对热性惊厥相关性癫痫患者SCN1A基因不同剪切位点突变剪切效应的分析以及对mRNA转录本水平的影响，探讨剪切突变的位置、剪切模式与表型严重程度的关系。 方法：应用聚合酶链式反应扩增(PCR)、变性高效液相色谱分析(DHPLC)和DNA直接测序等方法相结合，在热性惊厥相关性癫痫患者中筛查SCN1A基因所有的外显子以及与mRNA剪切相关的内含子序列。筛查所得的剪切位点突变和文献报道的确切剪切位点突变(c.265-1G>A,c.265-3C>A,c.265-3C>T,c.383+1A>G,c.474-13T>A,c.602+5G>A)并纳入此项研究。使用体外剪切报告―minigene分析剪切位点突变的剪切效应，对那些影响剪切的突变，进一步使用实时荧光定量聚合酶链式反应(Q-PCR)分析SCN1A基因突变后mRNA转录本的量。 结果： 在我们所有收集的病例组中，一共筛查出6个剪切位点突变：c.602+1G>A,c.3705+1G>T,c.4284+2T>C,c.473+5G>A,c.473+110A>G和c.4853-25T>A。 5个位于不变剪切点区域(-1,-2,+1和+2)的剪切位点存在一种或者2种异常剪切方式：既可以引起完全的相关外显子的删除，也可以是外显子删除和的方式，或者引起部分相关外显子删除与异常内含子插入相结合的方式；不变剪切点区域的突变，可以存在或者不存在正常转录本，即使存在正常转录本，其正常剪切转录本的量也远远低于异常剪切转录本的量，所对应的临床表型是最严重的癫痫类型Dravet综合征(DS)和Lennox-Gastaut综合征(LGS)。与此相反，2个距离外显子较远的深部内含子区域突变c.473+110A>G(有3个病人携带此突变)和c.4853-25T>A，只引起内含子序列的异常插入；这2个突变均产生2条转录本，一条正常转录本和一条异常转录本，而且正常剪切转录本的量远远高于异常剪切转录本的量；这两个突变所对应的是临床表型相对较轻的癫痫：热性惊厥（FS）、热性惊厥附加症（FS+）以及部分性癫痫伴热性惊厥附加症(PEFS+)。位于可变剪切位点(或称潜在剪切位点)(从-14到-3以及+3到+9)区域的突变对剪切的影响只有一种异常剪切方式：既可以是相关外显子的删除(包括完全外显子删除和部分外显子删除)，也可以是内含子序列异常插入。正常剪切转录本和异常剪切转录本的量的比例也可能随着其位置和剪切模式的变化而改变。这些区域的突变所对应的临床表型以及疾病的严重程度也存在一定差异。 结论： 1、首次在SCN1A基因中证实了同一个基因上剪切突变位点的位置与剪切效应有关，并且与表型严重程度相关。 2、首次发现了SCN1A基因突变所致的热性惊厥相关性癫痫的临床表型的严重程度与正常剪切转录本的量呈负相关。