孔子鸟属于比较原始的鸟类，在早期鸟类的起源与演化中也处于较早的阶段。孔子鸟具有一些比较原始的形态特征，如前肢具有发育的指爪、保留有爬行动物特有的眶后骨、龙骨突不发育等；同时孔子鸟的牙齿已经退化，是最早出现角质喙的鸟类。鲜明的原始特征与显著进步特征的并存，使得孔子鸟从发现之初就成为研究的热点。迄今为止，发现的孔子鸟化石已有数千件，包括了10个属种，其中川州孔子鸟与孙氏孔子鸟现已被普遍认为是圣贤孔子鸟的同物异名。孔子鸟生存在早白垩世时期，生存的时间跨度长达1000多万年，这在所有原始鸟类中是非常罕见的。有关孔子鸟的研究内容几乎涵盖了古鸟类研究的各个方面，而其中以骨骼形态的描述最多，也最详细。大量孔子鸟化石标本的发现对于研究早期鸟类的起源与演化起到了十分重要的作用。文章采用的化石主要来自天宇自然博物馆，馆内收藏的孔子鸟化石有600多件，其中有很多标本的骨骼形态保存的非常清晰，并且一些标本保存有精美的羽毛。通过对这些孔子鸟化石标本的仔细观察，选取了其中几件代表性的化石标本，对这些化石的骨骼与羽毛特征进行了详细的描述。通过对孔子鸟化石标本（13-32）骨骼形态的研究，判定它应该属于圣贤孔子鸟，结合的特征主要有以下几点：上下颌都没有牙齿，齿骨前端下方膨大；肱骨近端的三角肌嵴膨大并且被一卵圆形的膜孔穿透；第二指的中间指节强烈拱起。孔子鸟的飞羽结构与现生鸟类的差别已经不大，结合孔子鸟的骨骼形态特征，如强健的前肢骨骼、呈杆状的乌喙骨等，可以说明孔子鸟已经具有了较强的飞行能力。孔子鸟仍保存有腿羽，说明了在早期鸟类中后肢在鸟类的飞行过程中起到了一定的辅助作用。在各个成长阶段的孔子鸟化石标本中都有发现双长尾这一特征，曾经把它作为判定孔子鸟性别状况的主要特征，但是一些没有保存双长尾的化石标本可能是由于正在经历换羽，造成了尾羽的缺失，所以不能单独的依靠双长尾这一特征对其性别进行判定。尾羽远端羽毛的不对称性可以说明双长尾在孔子鸟的飞行过程当中也可能起到一定的辅助作用。