细粒棘球绦虫新疆株PDZ结构域蛋白(EgPDZ)基因的克隆及序列分析

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目的:从新疆株细粒棘球绦虫原头蚴中克隆PDZ结构域蛋白(Echinococcos granulosus structural domain protein of the PDZ, EgPDZ),进行序列测定和生物信息学分析。方法:设计EgPDZ基因特异性引物,用RT-PCR方法从细粒棘球绦虫原头蚴RNA中克隆EgPDZ基因并将其克隆至pMD18-T载体,测序确定序列并进行生物信息学分析。结果:RT-PCR扩增出一长度约600 bp的基因,测序显示其长度为627bp,编码208个氨基酸,等电点为4.76,为一新基因,命名为EgPDZ。SMART功能分析预测EgPDZ蛋白16~88氨基酸为PDZ结构域。同源性比较表明,EgPDZ与多房棘球绦虫EmPDZ同源性为97.60%,与血吸虫和人等其他种类PDZ基因同源性在18.16%~26.42%之间,而PDZ结构域的序列相似度为42.47%~98.63%。进化树分析表明EgPDZ与EmPDZ相聚集,与其他物种同源性较低。结论:成功克隆出细粒棘球绦虫EgPDZ新基因,为进一步研究该基因在细粒棘球绦虫与宿主相互作用中的功能奠定基础。
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