综合利用水利工程是我国基础水利设施建设的重要组成部分,其投资开发兼顾兴利与除害等多项功能,在提高水资源开发利用效率以及抵御各种水旱自然灾害方面发挥了重要作用,较好地满足了实现经济和社会协调可持续发展的战略需要。由于综合利用水利工程一般具有投资规模大、建设周期长等特点,通常需要防洪、发电、排涝、灌溉、航运、环保等多个相关部门共同参与才能保证项目的有效实施。解决好综合利用水利工程各受益部门之间的投资费用分摊问题,不但有助于选择经济合理的开发方式和建设规模,提高项目经济评价分析的全面准确性,改善综合利用水利工程的经营管理水平,而且为研究工程项目建设资金筹集分配方式和编制各国民经济部门投资发展规划提供了必要的参考依据。综合利用水利工程建设项目的投资费用分摊并没有公认统一的分析方法,一直以来都是项目经济评价研究领域的难题。本文首先对水利部相关规范中推荐采用的几种传统投资费用分摊方法的基本原理和内容分别进行了相应介绍,同时对其各自的优缺点和适用性作了详细深入地比较分析,在此基础上将多人合作博弈理论方法引入综合利用水利工程投资费用分摊过程,提出了相对更加公平合理的剩余费用缺口比例分摊法,并探讨和研究了基于概率统计理论的离差平方法在综合分析确定投资费用分摊系数方面的有效应用。