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目的:探讨胃癌细胞系AGS转染EBV基因组前后多态性位点的改变。分析肌动蛋白超家族蛋白 21 B(Kinesin superfamily protein 21B,KIF21B)rs2297911 位点、成虫大盘基因类似物5(Discs large homolog 5,DLG5)rs1058198位点、小核RNA激活蛋白质复合体(small nuclear RNA-activating protein complex,SNAPc)rs3812561 位点以及微管相关蛋白 9(microtubule-associated protein 9,MAP9)rs1058992 位点多态性与 EB 病毒(Epstein-Barrvirus,EBV)相关肿瘤易感性的相关性,包括EBV相关/阴性胃癌(EBV-associated/-negative gastric cancer,EBVa/nGC),EBV相关/阴性鼻咽癌(EBV-associated/-negative nasopharyngeal carcinoma,EBVa/nNPC)和 EBV 相关/阴性淋巴瘤(EBV-associated/-negative lymphoma,EBVa/nL)。方法:①采用高通量测序技术检测胃癌细胞系AGS转染EBV前后宿主细胞基因多态性位点的变化。②将AGS与AGS-EBV细胞系差异多态性位点所在基因通过FunRich这一开放访问的网络工具进行分类。③选取KIF21B(rs2297911),DLG5(rs1058198),SNAPC4(rs3812561)和 MAP 9(rs1058992)4 个位点,利用 Agena MassArray 系统基因分型。④基因分型数据均采用卡方检验,非条件Logistic回归计算比值比(odds ratio,OR),P≤0.05为差异有统计学意义。所有统计分析均采用SPSS 21.0软件进行。结果:①在 AGS 和 AGS-EBV细胞,SNP(single nucleotide polymorphism 单核苷酸多态性)位点在基因中的分布位置以非编码区为主,外显子编码区、3’UTR、基因间区、5’UTR、基因下游区域、基因上游区域和基因剪切位点SNP分布数目依次减少。对比两组细胞系SNP位点,筛选出AGS-EBV克隆样本中均与AGS细胞系中存在基因型别差异的SNP位点。差异SNP位点分布比例与总体比例大体一致,以非编码区SNP位点为主,无基因剪切位点SNP位点。②通过高通量测序共检测到928个差异SNP位点,上述SNP所在基因共涉及178个细胞组分,共参与37个生物学过程,所在基因共包含有253种蛋白结构域,共涉及773个生物学通路。③KIF21B(rs2297911),DLG5(rs1058198),SNAPC4(rs3812561),MAP9(rs1058992)检测均符合 HWE 平衡(rs2297911:χ2=1.225,P>0.05;rs3812561:χ2=1.457,P>0.05;rs1058198:χ2=0.116,P>0.05;rs1058992:χ2=0.085,P>0.05),表明所选对照样本来自于遗传平衡的群体。④EBVaL与对照组比较,KIF21B基因rs2297911位点基因型分布及等位基因分布差异显著(P均<0.05)。G等位基因是EBVaL的危险因素(P=0.009,OR=1.872,95%CI:1.169~2.998);EBVaNPC 与 EBVaL 相比,KIF21B(rs2297911)基因型分布及等位基因频率不同(P均<0.05),在G的隐性模型中,EBVaL的GG基因型频率高于EBVaNPC和EBVnNPC(P=0.013,OR=2.125,95%CI:1.169~3.864;P=0.047,OR=4.444,95%CI:1.101~17.939)。EBVaL与NPC(包括EBVaNPC和EBVnNPC)之间的G等位基因也存在显著差异(P=0.005,OR=1.961,95%CI:1.215~3.163;P=0.009,OR=3.241,95%CI:1.297~8.097);其余各组两两比较,基因型分布及等位基因频率均无明显差异(P>0.05)。⑤EBVaGC与EBVnGC组比较,MAP9基因rs1058992位点基因型分布(P<0.05)及等位基因频率(P<0.05,OR=1.904,95%CI=1.141~3.179)比较差异均有显著性。C隐性模型中,EBVaGC与EBVnGC组比较具有明显差异(P=0.006,OR=2.558,95%CI=1.316~5.010)。EBVnGC与正常对照组C等位基因频率比较差异有显著性(P<0.05,OR=1.724,95%CI=1.036~2.870);其余各组两两比较,基因型分布及等位基因频率均无明显差异(P>0.05)。⑥SNAPC4基因rs3812561位点和DLG5基因rs1058198位点在患者和正常对照组中,基因型及等位基因均无统计学差异(P均>0.05)。结论:①EBV感染可导致AGS细胞基因出现大量SNPs,提示其感染参与宿主细胞基因结构发生改变的过程。②KIF21B(rs2297911)G等位基因在隐性模型与显性模型中均为EBVaL易感危险因素。③EBVaGC与EBVnGC组比较,MAP9(rs1058992)位点基因型分布及等位基因频率比较差异均有显著性,CC基因型及C等位基因是EBVaGC的危险因素;EBVaGC组较正常对照组C等位基因频率明显增加,C等位基因为EBVaGC危险因素。④SNAPC4基因rs3812561位点和DLG5基因rs1058198位点多态性与EBV相关肿瘤易感性无明显相关性。