在“大众创业、万众创新”的背景下,南京市在提升区域创新能力、增强自主创新能力方面进行积极探索,形成了一定的创新氛围与创新优势,但现有区域创新生态系统的优化空间。在经济步入新常态的形势下,创新驱动和转型发展的迫切要求南京市优化区域创新生态系统。全文围绕创新生态系统理论,根据南京的的实际情况,就如何优化南京创新生态系统进行了研究。正文第一部分介绍了区域创新生态系统的的研究基础,特别是详细梳理了国内外有关的研究现状,并进行了评析。且对南京市本土化研究做了分析,发现目前关于南京市创新生态系统的研究仍有空白,故引出本选题。第二部分重点梳理和总结了区域创新生态系统的基本理论,界定了创新的本质、区域创新生态系统的内涵及创新与发展的内在关系,并从创新的本体出发,深度挖掘了创新的五个过程,进而分析区域创新生态系统支持创新过程的五个要素,即产业定位、创新资源、网络互动、公共服务及动力机制。第三部分以整体的城市创新生态系统为分析框架,通过对五个要素的逐个分析,探讨了政府如何在不能导致市场机制破坏、资源环境的恶化和政府法治受损前提下在优化创新生态系统中的发挥作用。第四部分则是根据理想状态下的五个要素为分析框架,梳理南京市目前政府已出的产业政策,来对南京市的创新生态系统建设现状中的问题进行深度剖析。第五部分针对南京市的具体问题提出对应政策并做出制度化表述以保证对策建议的可操作性和直接应用性。具体政策为:明确创新定位,建立创新认定标准;针对性供给创新资源,强化产业生态系统;畅通内外互动网络,对接现有创新资源;完善知识产权管理系统;建立专门的政府创新管理责任部门;提高公众创新意识,培育具有企业家精神的创新文化;分阶段干预创新,维护公平、正义的市场环境。