虚拟博物馆的建设已逐渐成为信息化领域的热点问题。但是，自然科技资源虚拟博物馆的建设还为数不多，相关理论研究也比较缺乏。为了对自然科技资源虚拟博物馆功能设计过程与基本功能找到较为通用的方法，本文对自然科技资源虚拟博物馆的功能设计进行了研究。首先，探讨了传统博物馆与信息的关系，并提出虚拟博物馆的核心作用在于通过多媒体手段将展品信息传递给观众。其次，由经济学的供求理论得出自然科技资源虚拟博物馆的功能应由主体的需求决定的结论，并对几类典型主体进行了需求分析，从而指出设计原则在于对需求层次进行分层处理和持续加以改进完善等。接着，进行了案例研究，对现有的一些比较典型的自然科技资源虚拟博物馆进行了功能分析，并结合示意图进行了功能描述。最后，用系统分析法的六个步骤对自然科技资源虚拟博物馆功能设计过程进行了阐述，并结合实践进行说明。提出虚拟博物馆应该具有的基本功能，并对典型的自然科技资源虚拟博物馆功能方案进行了对比选择。