东疆油气区主要指新疆自治区乌鲁木齐以东，包括准噶尔盆地准东地区、准噶尔盆地南缘地区、三塘湖盆地、吐哈盆地和柴窝堡凹陷等含油气盆地及凹陷地区。油气勘探证实二叠系为新疆东部地区最重要的油气地层单元，其中，中二叠统地层在该区各含油气区带分布广泛，是其主要的烃源岩层位。目前，中二叠统地层是三塘湖、准东、准南及柴窝堡等含油气区带重要的勘探层系及烃源岩发育层系，是东疆地区油气勘探和开发的关键性层系。同时，该区中二叠统地层分布广泛，沉积类型多样，生物化石丰富，是研究中国湖相烃源岩地球化学特征的的最好地层之一。前人的研究显示东疆地区不同油气区带二叠系烃源岩地层在沉积环境、有机质类型和热演化程度方面具有一定的相似性，然而油气勘探的现状显示该区不同盆地和区块之间，二叠系油气藏差别较大。　　为了深入研究二叠系烃源岩及其沉积环境对新疆东部地区不同盆地二叠系油气藏生成的影响，对区内各盆地和凹陷中二叠统烃源岩地球化学特征进行研究。结合研究区地质背景，从地层划分、烃源岩有机地球化学特征及元素地球化学特征等多角度入手，运用多种方法对东疆地区主要盆地中二叠统烃源岩的地球化学特征、沉积环境及油气生成特征进行了系统研究。　　烃源岩综合评价表明，研究区中二叠统烃源岩样品大部分评价为优质烃源岩，有机碳含量和生烃潜量较高，具有好的生烃潜力;烃源岩有机质类型以Ⅱ1和Ⅱ2型为主，为典型的湖相优质烃源岩;热演化程度处于低成熟-成熟阶段。　　特殊生物标志物-短链甾烷的研究表明，东疆地区主要盆地在中二叠统时期具有相似的沉积环境、母源和生烃特征:均以干旱条件下的咸化湖相、分层水体环境为主;水体中藻类（红藻及粘球形藻等）等低等水生生物和微生物发育;这些原生有机质在沉积早期过程中经历过微生物改造作用;原始有机质与微生物降解的产物在地质条件得以共同保存，共同成为生烃的母质。　　东疆地区不同盆地中二叠统烃源岩的不同生物标志物参数相关性的研究表明，东疆地区中二叠统烃源岩的地质保存和生烃演化特征存在差异。不同盆地的烃源岩所经历的微生物作用、成熟度条件并不相同。　　对烃源岩地球化学特征的研究，不仅可以反映烃源岩有机质从形成、沉积到成岩过程的环境特征，也可以反映有机质的热演化程度及成藏过程中所经历的地质环境特征。这一系列的沉积环境和地质特征对烃源岩的生烃和油气藏形成具有决定性作用。东疆油气区中二叠统烃源岩地层油气资源勘探在不同盆地和凹陷存在着一定差异，前人从构造差异、储层条件等做了大量卓有成效的工作。本次研究表明，东疆地区不同盆地中二叠统烃源岩的地球化学特征存在着较明显的差别:利用分子地球化学的手段，通过深入研究烃源岩的生物标志物特征和元素地球化学特征，显示相同层系和类型的烃源岩具有一定的差异，反映了它们所经历的原始沉积环境和地质保存条件存在一定的差异，特别是不同地区中二叠统烃源岩的热演化程度和微生物作用程度明显不同。在不同的地质条件下，有机质的来源、热演化程度及微生物对有机质的改造程度的不同，不仅对各盆地和凹陷的油气形成具有一定的影响作用，对相关地区油气藏的形成和油气资源的勘探也有重要意义。