急性淋巴细胞白血病基因组和表观遗传学全貌研究

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急性淋巴细胞白血病(ALL)是儿童和青少年中最常见的恶性肿瘤,在成人急性白血病中占20%,大多数ALL来源于B细胞系(B-ALL)。与儿童相比,成人B-ALL的预后极差。目前,关于成人病例的基因组学研究仍较缺乏,对其进行研究并将其与儿童ALL基因组的差异进行比较,将有助于进一步认识该疾病的发病机制。我们采用了全外显子组测序、拷贝数变异检测和细胞遗传学/分子生物学方法,对95例B-ALL患者的体细胞突变进行了研究,其中成人43例,儿童52例。同时在378例扩大样本中进行了针对目的基因的深度测序,包括成人179例,儿童199例。在全外显子组测序中,我们发现84个基因有重现性突变。将所有重现性基因的突变以及拷贝数变异信息整合分析并按照功能分类后发现,共有9个功能类别受到累及,包括重要的融合基因、表观遗传学修饰物、信号传导分子、造血和淋巴系统发育相关的转录因子、对肌动蛋白结合和细胞骨架起调节作用的分子、肿瘤抑制因子、离子结合蛋白、跨膜蛋白以及一些其他功能的分子。其中部分类别的基因之间具有互相协作和互相排斥的关系。我们认为,B-ALL的发病很有可能有两种主要的机制:一种发病机制主要由重要的融合基因所驱动,同时转录因子和肿瘤抑制因子一起产生协同作用;而另一种机制则除了转录因子和肿瘤抑制因子的作用之外,另外一些功能分类的基因突变,如表观遗传学修饰基因、信号传导分子、离子结合蛋白和跨膜蛋白等功能领域的基因,可协同作用并模仿了融合基因的致病作用,从而导致ALL的发病。同时,在我们的研究中发现,组蛋白/DNA甲基化修饰基因(histone/DNA methylation modifiers,HMMs),包括MLL2、SETD2、ASXL1、EZH2、KDM5C和TET2,若发生突变,无论在成人还是儿童中均可能示相对较佳的预后。综上,我们对成人B-ALL病例的基因组学异常谱进行了阐述,并将其与儿童病例相比较,将可促进人们对白血病发病机制的深入理解,并有助于发现潜在的新型预后标志。
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