近些年来,突发性的公共卫生事件不断增多。突发性公共卫生事件往往出现的比较突然、发展势态较快,对公众的身体健康会造成一定的影响,同时还会引起一定程度上的恐慌。鉴于其对公众和社会产生的危害之大,媒体在对突发公共卫生事件进行报道时,要特别注意对议题的设置。2003年,肆虐中华大地的“非典”和10年之后,2013年给国民带来又一阵恐慌的H7N9疫情,都属于对公众影响较大的突发公共卫生事件。而在这两次事件中,媒体在报道过程中对议题的设置都有各自的特点。本文分别对两次突发公共卫生事件中,媒体报道的议程设置进行分析,发现,进行理性的议程设置需要遵循议程设置两个层次的要求,一方面要将受众关心的议题体现在报道当中。另一方面要主动掌握引导舆论走向的主动权,通过议程设置,将公众舆论向更健康发展的方向引导。