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目的：通过检测十二指肠腺癌组织及癌旁正常组织中的基质金属蛋白酶-9（MMP-9）、runt相关转录因子3蛋白(RUNX3蛋白)的表达，分析MMP-9和RUMX3蛋白在十二指肠腺癌的表达及临床意义，结合随访资料进行生存分析，判断MMP-9、RUNX3与十二指肠腺癌患者预后的关系。方法：调取普外科2004年—2010年十二指肠腺癌手术病例60例及相应癌旁组织40例，采用免疫组化SP法检测其MMP-9及RUNX3蛋白的表达情况。分析二者与十二指肠腺癌的发生、发展及临床病理参数和预后等的关系。所有资料均应用SPSS17.0统计软件包进行统计学处理。结果：(1)MMP-9的表达情况MMP-9在十二指肠腺癌中的表达率为70%，明显高于癌旁组织（27.5%），差别有统计学意义(χ2=17.4，P<0.01)，MMP-9表达与十二指肠腺癌的浸润深度、分化程度和淋巴结转移密切相关，而与性别、年龄、肿瘤大小与肿瘤发生部位无关；侵犯浆膜及浆膜外组明显高于侵犯粘膜及肌层（P=0.017），低分化组明显高于高、中分化组(P=0.029)，有淋巴结转移组明显高于无淋巴结转移组(P=0.007)，差异有显著性。(2)RUNX3蛋白的表达情况RUNX3蛋白在十二指肠腺癌表达率(23.3%)明显低于癌旁组织(77.5%）差异有统计学意义（P＜0.01），RUNX3蛋白表达与肿瘤分化程度及淋巴结转移有关与其他病理参数无关，中、高分化组明显高于低分化组（P=0.001），无淋巴结转移明显高于有淋巴结转移(P=0.033)。(3)MMP-9与RUNX3蛋白表达与患者预后的关系统计显示MMP-9阳性组其一年、三年、五年生存率分别为71.0%，36.9%，7.4%;MMP-9阴性组其一年、三年、五年生存率为88.1%、49.0%、28.0%，阴性组与阳性组生存率差异有显著性（χ2=8.027，P=0.005）；在RUNX3阳性表达组十二指肠腺癌的一年生存率为85.7%，三年生存率为68.6%，五年生存率为34.3%，而RUNX3阴性组其一年、三年、五年生存率分别为73.6%,32.5%,9.8%，差异有显著性意义（χ2=8.491，P=0.004）(4)十二指肠腺癌组织中MMP-9与RUNX3蛋白表达之间的相关性在42例MMP-9阳性表达十二指肠腺癌组织中有36例RUNX3蛋白表达阴性，阴性表达率为85.7%；在18例MMP-9表达阴性十二指肠腺癌组织中有8例RUNX3表达阳性，阳性率为44.4%，两者之间比较差异有统计学意义（χ2=6.406，P=0.011），且统计显示两者具有明显的相关性(r=0.311)。结论：（1）MMP-9促进了十二指肠腺癌的浸润和转移，可作为评判十二指肠腺癌侵袭力的一个重要指标，其可为临床治疗十二指肠腺癌提供新的途径（2）RUNX3在不仅像传统抑癌基因参与了十二指肠腺癌的发生，同时RUNX3也参与了十二指肠腺癌的发展。（3）研究RUNX3蛋白在十二指肠腺癌中的表达情况，补充了RUNX3在消化系统十二指肠段表达的空白，更加证明RUNX3与消化道肿瘤关系密切。（4）MMP-9的表达可作为判断十二指肠腺癌的预后指标，RUNX3蛋白也可作为判断十二指肠腺癌预后的指标。（5）MMP-9和RUNX3相互影响，共同作用于十二指肠腺癌发生和发展