鹅PRL基因5'端调控区克隆、SNPs检测及与产蛋性能的关系

来源 :安徽农业大学 | 被引量 : 3次 | 上传用户:zhaochunbo123
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动物垂体前叶分泌的催乳素(Prolactin,PRL)具有广泛的生理效应,在家禽中PRL主要与就巢和繁殖性能有重要关联。我国地方禽种强就巢性是其产蛋量低的主要因素之一。禽类血浆PRL水平上升与就巢行为的起始和维持具有密切的相关性。本研究以中国优良的地方鹅种皖西白鹅(n=200)和引入的莱茵鹅(n=80)作为研究素材,将PRL基因作为产蛋量性状的候选基因,通过比较基因组学方法,应用Dnastar和Primer Premier 5.0软件,设计了1对引物对鹅PRL基因的5’调控区序列进行克隆测序。运用PCR-SSCP技术对鹅PRL基因外显子2和5’调控区序列片段分别进行多态性分析并结合测序,检测其基因突变位点,并分析基因型及与鹅产蛋性能的相关性。克隆了鹅PRL基因5’调控区的部分序列(GenBank登录号:EF190486)。序列比较分析表明,与家鸡的同源性为73%,与Ceylon jungle fowl(锡兰原鸡)和日本鹌鹑的同源性分别为78%和69%,各物种之间调控区序列变异比较大。在鹅PRL基因5’调控区发现3个SNP,即A-401G、G-268A和T-266A。应用TFSEARCHver1.3软件对PRL基因5’调控区潜在的调控元件和蛋白结合因子预测发现:在-401位没有转录结合因子,发生A-401G突变后仍然没有结合因子。在发生G-268A和T-266A突变前,有转录结合因子GATA-2和GATA-1,但是突变后这两个结合因子全部消失。经分析表明三个碱基突变为连锁变异,对基因的表达调控可能发挥调节作用。皖西白鹅P2引物扩增获得2个等位基因,频率分别为0.7275和0.2725,三种基因型(AA、AB和BB)的频率分别为0.615、0.225和0.16;E2引物扩增的两个等位基因频率分别为0.665和0.335。莱茵鹅P2引物扩增获得2个等位基因,频率分别为0.6688和0.3312,三种基因型的频率分别为0.5625、0.2125和0.225;E2引物扩增的两等位基因频率分别为0.6125和0.3875。?~2检验表明,两个鹅群在P2和E2检测位点均处于Hardy-Weinberg不平衡状态。对鹅早期产蛋性能与各多态位点的基因型进行关联分析,结果显示,PRL基因5’调控区碱基突变对皖西白鹅产蛋量有影响,表现为AA型产蛋量显著低于AB型和BB型(P<0.05)。PRL基因外显子2碱基突变对鹅的开产蛋重有影响,表现为皖西白鹅CC基因型开产蛋重显著(P<0.05)小于CD型和DD型;莱茵鹅EE基因型开产蛋重显著(P<0.05)小于EF型和FF型。
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