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为了促进标记辅助选择技术在水稻育种中的应用，对利用分子标记进行水稻抗病性遗传改良的有关问题进行了研究：1)在筛选与抗病基因紧密连锁的分子标记的基础上，通过分子辅助回交育种方法，把抗病基因导入到优良的杂交稻亲本中，并对分子标记辅助选择的效果作了评价；2)对在系谱法育种过程中，利用标记辅助回交方法，选育抗病新品种的可行性进行了探讨；3)利用近等基因系对初步定位的细条病抗性QTL进行了验证。主要结果如下： 1、利用已公布的水稻基因组信息，获得了1个与抗稻瘟病基因Pi-1紧密连锁的SSR标记(MRG4766)，它与Pi-1的遗传距离仅1.3cM；获得了3个与抗稻瘟病基因Pi-2(Pi-9)紧密连锁的SSR标记SRM22、SRM24和SRM91，它们与Pi-2(Pi-9)的遗传距离分别为0.73、0.08和1.09cM。 2、利用SSR标记RM224对Pi-1选择的准确率在90％以上；而用MRG4766对Pi-1选择的准确率高达98.0％。若同时用RM224和MRG4766对Pi-1进行选择，则准确率可达100％。用SRM24对Pi-2选择的准确率为97.9％—100％；同时利用SRM22和SRM91对Pi-9进行选择的准确率则达到100％。 3、以LAC23、5173和75-1-127为Pi-1、Pi-2和Pi-9的供体亲本，通过标记辅助回交育种，分别将这些抗稻瘟病基因导入到一些优良的三系和两系杂交稻的遗传背景中。获得了8个导入Pi一I的珍汕97B近等基因系，其遗传背景恢复率为93.1%一97.5%;获得10个导入尸1-2的珍汕97B近等基因系，其遗传背景恢复率为93.0%一98.3%。此外，还获得了一批以金山B一1和金山S一1为受体亲本，分别导入这3个抗病基因的BCIFI和BCZFI代个体。4、证明在系谱法选育保持系的同时，利用标记辅助回交进行抗病性改良是可行的，能加快抗病不育系选育的速度。获得了6个导入抗白叶枯病基因XaZI的优质保持系JsBg的近等基因系，其遗传背景恢复率为92.7%一97.0%，平均为94.8%。5、通过传统回交方法育成了抗性与供体亲本Acc8558相近的H359近等基因系H359R。图示基因型分析表明，该近等基因系携有3个来自抗性供体亲本的包含主要抗性QTL的染色体区段，证实了先前对细条病抗性QTL初步定位的可靠性;同时显示，只要聚合4一5个以上主要QTL的抗病等位基因，即能培育出高抗细条病的品种。