城市滨水区域是城市开发中的重要资源，在提高环境质量、丰富地域风貌等方面具有重要的价值。在保护生态环境及可持续发展思想下，城市滨水区域独特地位正受到人们越来越普遍的关注，城市滨水区域的复兴成为世界性的潮流。 本文通过对南京市主城区主要滨水区域历史与现状的分析，主要从水域、水陆交接区域、滨水陆域进行了城市滨水区域景观生态研究的相关探讨。结果表明，南京主城区虽然拥有较丰富的水域自然和文化资源，但存在分布不均衡，且在建设和使用过程中水体面积减少较多、水体连通性下降等景观生态问题；在水陆交接区域存在硬质驳岸过多，形式单调、缺少生态性和人水亲和性等问题；滨水陆域往往拥有比较丰富的历史和优美的自然环境，但在近期的建设利用过程中由于缺乏规划和控制等原因，景观和生态上存在一定的局限性。 针对现实状况，本文对南京滨水区域的景观生态建设提出了相关对策建议，并分别对水域、水陆交接区域、滨水陆域初步提出了保护和整治的思路与操作方法。同时结合研究，对部分南京滨水区域景观生态建设作了大胆的构想。