抗病毒治疗乙肝病人TCR可变区的深度测序分析

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背景:据世界卫生组织报道,全球约有20亿人曾感染过HBV,并且3.5亿人为慢性感染者,每年大约有100万人死于HBV感染所导致肝硬化、肝衰竭和原发性肝癌。我国为慢乙肝流行高发区域,慢性HBV感染者约9300万,其中有症状需要治疗的活动性乙型肝炎患者约为2000多万。慢性乙型肝炎患者的抗病毒疗效受病毒自身和宿主等因素的影响,而宿主的细胞免疫状态是治疗应答的重要因素之一,在肝细胞的损害及病毒的清除作用中发挥重要的作用。在急性自限性HBV感染中,针对HBV的细胞免疫反应比较强,然而在慢乙肝中,针对HBV的细胞免疫反应要弱得多。感染的病毒通过免疫介到引起肝细胞的损害,T细胞功能异常可能是导致HBV感染慢性化的根本原因。目前的慢乙肝主要治疗措施是:保肝药物、抗病毒及免疫调节治疗,均不能彻底根除乙肝。在HBV的免疫应答过程中,特异性细胞毒性T细胞(CTL)决定了疾病的转归及在清除病毒中发挥了重要作用。T细胞受体(T cell receptor,TCR)决定了CTL特异性,TCR的特性主要取决于可变区V区的分子组成。研究TCR的组成特点有助于深入理解HBV免疫应答的反应机制。近年来,随着新一代测序技术的飞速发展和人类基因组计划的完成,高通量测序技术(High-throughput sequencing)即深度测序和“下一代”测序(Next genenrationsequencing)具有高通量、操作平台简易、质量高等优点,已被应用医学的各个领域。本实验主要利用慢性乙型肝炎患者治疗前后的外周血淋巴细胞扩增β链可变受体区域进行高通量测序,分析受体区CDR的种类变化及克隆株的变化,从而帮助阐明CHB患者的细胞免疫应答的特点机制,为揭示慢性乙型肝炎的发病机制、有效治疗策略提供实验研究的新思路及技术平台,从而为慢性乙型肝炎的免疫治疗提供帮助。目的:利用Ion Torrent高通量测序技术观察慢乙肝患者治疗前后TCR β链V区家族性基因的差异性表达,为深入探讨慢乙肝患者的发病机制奠定实验基础。材料与方法:(1)研究对象:收集2010年3月-2013年12月就诊于首都医科大学附属北京佑安医院门诊的临床治疗有效的HBeAg阳性的慢性乙型肝炎患者,所有患者均符合2010年版《慢性乙型肝炎防治指南》的诊断标准。排除合并其他病毒感染、其他原因引起的肝病、慢乙肝不适合抗病毒治疗的患者。(2)方法:收集慢乙肝患者的外周血,分离单个核细胞;提取总RNA后提取mRNA;逆转录合成cDNA,后扩增TCRβ链V区基因,通过切胶回收后制备文库高通量测序。结果:样品产生的380,000reads,同时考虑V、J家族基因,将所有30个V家族和J家族的基因构建数据库,做Blast,发现有15个基因上调,2个基因(TRBV28_TRBJ1.5,TRBV6_TRBJ2.10)上调最为明显,有统计学意义。结论1.通过高通量测序,挑选出了TRBV/TRBJ在慢乙肝患者CD8+T细胞的异常表达,TRBV10_TRBJ2.1,TRBV10_TRBJ2.2,TRBV10_TRBJ2.7,TRBV12_TRBJ1.1,TRBV27_TRBJ2.2TRBV28_TRBJ1.5,TRBV6_TRBJ2.1,TRBV6_TRBJ2.1可能与HBV的发生及发展相关。2.通过比较分析,初步推测TRBV28_TRBJ1.5,TRBV6_TRBJ2.1可能与HBV治疗效果相关。
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