现代经济增长理论认为，公司创新是公司价值增长的重要源泉，追求公司价值最大化是财务管理的终极目标。实现公司价值最大化，是公司通过战略管理、财务管理的相互协调配合才得以实现的。由于创新战略的高风险性和资金投入的持续性，公司在实施创新战略时，需要采取一个宽松的财务区间的财务策略来与之配合，才能保创新战略的平稳、持续进行。以此为切入点，本文重点讨论了研发投入与资本结构对公司价值的交互影响，即公司在实施创新战略时，应具有怎样的资本结构，才能实现公司价值最大化。针对该问题的提出，本文收集了全部中小板上市公司为样本，在剔除了极端值、缺失值和特殊行业后，截取了2009年至2012年四年的1271个观测值；选择最具有综合性和代表性的市账比作为公司价值的替代变量，以研发投入强度作为创新战略的替代变量，以年末资产负债率作为资本结构的替代变量，控制变量的选择了具有代表性的净资产收益率和成长性。借助SPSS STATISTICS20软件进行OLS（最小二乘法）回归分析，为了消除多重共线性保证结果的准确性，自变量和控制变量较因变量均滞后一年。在进行了全观测值得回归分析后，将全体观测值按年末资产负债率的中位数为界限分为高资本结构和低资本结构两个子样本组分别进行了回归分析。结果发现：（1）中小板上市公司研发投入越高，公司价值越大；（2）中小板上市公司资本结构越低，公司价值越大；（3）资本结构较低的公司相比资本结构较高的公司，研发投入对公司价值的促进作用更明显。该结果说明上市公司创新战略与资本结构会对公司价值产生交互影响，公司在实施创新战略时，应保持较低资本结构的财务策略与之相配合，从而提高公司价值。为了保证结果的正确性，在稳健性检验中，将托宾Q值作为公司价值的替代变量再一次进行回归分析，其结果与之前的结果保持一致。