毛细管电色谱(CEC)的高柱效、高选择性取决于其柱结构和所采用分离介质的性质。纳米材料具有比表面积大、表面易于改性等特征,采用纳米尺寸的固定相并设计特殊结构的色谱柱,设计新型色谱分离系统,发展普适的高效毛细管电泳分离分析方法具有重要意义。将核壳结构Fe3O4@SiO2纳米材料的表面进行改性,制备成纳米尺寸的阴离子交换、强阳离子交换和反相色谱固定相。利用磁性纳米固定相磁响应好、便于操作的特点,采用永久磁铁固定的方法构建了新型的磁固定磁性固定相毛细管电色谱柱。在阴离子交换固定相CEC柱中,以有机酸为测试样品,优化其分离条件,并对天麻提取物进行分离,证实了该CEC柱具有良好的分离性能；对用于制备强阳离子交换固定相的核壳结构Fe3O4@SiO2材料进行表征,结果表明Fe3O4@SiO2粒径为100nm,其饱和磁化率高达41.2 emu/g,红外表征结果表明,Fe3O4@SiO2表面成功引入磺酸基,并对该色谱柱的分离性能进行初步评价；将阴离子交换和反相色谱固定相按一定比例混合,构建磁固定阴离子交换／反相混合固定相毛细管电色谱,从理论说明其电渗流的特征,并分别在不同固定相配比及不同磁铁对数条件下进行实验,结果表明,理论与实验结果相符,证实了通过调节固定相配比或磁铁对数可以便捷地调节电渗流的大小。本文还构建了3种类型的固定化pH梯度毛细管整体柱,并以5μm的多孔硅胶为基质,制备了新型固定化pH梯度毛细管填充柱,并用于蛋白质的分离,结果表明,其在蛋白质研究中有良好的潜在应用价值。