基于核函数的贝叶斯半参分位数回归模型及其对异常ADS的诊断

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细胞分裂时间的调控在细胞分化和组织发育过程中具有十分重要的意义。本文通过研究秀丽隐杆线虫的母代细胞存活时间与子代姐妹细胞分裂时间差(ADS),筛选调控姐妹细胞分裂的不同性的基因。因为可以很容易观测秀丽隐杆线虫从胚胎到成虫的全部发育过程,并且发育过程中的每一个细胞都可以记录其存活时间,所以秀丽隐杆线虫对于研究姐妹细胞分裂时间差是很好的模型。Wing等人的研究只分析了秀丽隐杆线虫的子代姐妹细胞分裂时间差,并对异常秀丽隐杆线虫个体的ADS进行诊断。通过研究野生型秀丽隐杆线虫母代细胞时间与子代姐妹细胞时间差之间的Spearman秩相关检验和Pearson相关检验结果,发现它们之间具有一定的相关性。本文为了充分利用细胞生存时间数据的信息,强调细胞生存时间和姐妹细胞分裂时间差的相关现象,首先,对野生型秀丽隐杆线虫的分裂数据进行分类,把相同标签的细胞存活时间和与其对应的子代姐妹细胞分裂时间差放在同一数据集;然后,我们采用基于核函数的贝叶斯半参分位数回归模型,估计每一个数据集的0.975分位数线和0.025分位数线,0.975分位数线和0.025分位数线构成一个置信区间带,进而对异常秀丽隐杆线虫个体的姐妹细胞时间差进行诊断。对基于核函数的贝叶斯半参分位数回归模型进行的六种模拟,初步证明了该方法的合理性。与Wing等人的方法比较,该方法可以诊断出更多异常个体的ADS,这为筛选调控姐妹细胞分裂的不同性的基因提供了新方法。
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