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本文通过构建及分析单分子AGR2,BIK,CDH3,CLDN3在人类正常邻近组织和肺癌之间的计算网络,为肺癌的整合诊断,和治疗奠定基础并开辟新途径。通过整合相关系数、散点矩阵、GRNInfer及GO知识库分析等方法,构建了 AGR2和BIK在低表达人类正常邻近组织和高表达肺癌之间相同及不同的激活和抑制机制网络。AGR2结果显示:人类正常邻近组织相比肺癌,相同的激活机制是跨膜受体介导的跨膜丝氨酸蛋白酶4,CD24分子,紧密连接蛋白3诱导前B细胞分化,不同的激活机制是受体介导的S100钙结合蛋白A2,细胞因子受体样因子1,假蛋白FLJ22184诱导的体液免疫应答;相同的抑制机制没有结果;不同的抑制机制是自然杀伤细胞介导的原钙粘蛋白7,垂体肿瘤转化3,2号染色体开放阅读框27,蛋白激酶C诱导的炎症反应。肺癌相比人类正常邻近组织,相同的激活机制是蛋白结合介导的着丝粒蛋白F,细胞周期蛋白B1诱导有丝分裂;不同的激活机制是蛋白结合介导杆状病毒IAP5,透明质酸介导的运动受体(RHAMM),驱动蛋白家族成员4A,细胞分裂周期2G1期向S期和G2到M,KDEL(LYS-ASP-GLU-LEU)内质网蛋白保留受体,高迁移率族的AT-钩1,细胞分裂周期关联蛋白8诱导有丝分裂;相同的抑制机制没有结果;不同的抑制机制是转录共激活因子介导的POU2级相关联因子1,微管相关丝氨酸/苏氨酸激酶1诱导的转录。BIK结果表明:人类正常邻近组织相比肺癌,相同的激活机制是丝氨酸型内肽酶介导的转录因子AP,REX2RNA的核酸外切酶2同源(酿酒酵母),烯醇化酶1,锌指蛋白384,前列腺素E合成酶诱导的体液免疫应答;不同的激活机制是丝氨酸型内肽酶介导的细胞因子受体样因子1,基质金属9(明胶酶B,92kDa明胶酶,92kDaIV型胶原酶),透明质酸结合蛋白2诱导的巨噬细胞分化;相同的抑制机制是受体介导的肿瘤坏死因子受体诱导的细胞因子-细胞因子受体相互作用;不同的抑制机制是受体介导的高迁移率族3样1,异戊酰辅酶A脱氢酶,凝血因子Ⅱ(凝血酶)受体样1诱导的神经活性配体-受体相互作用。肺癌相比人类正常邻近组织,相同的激活机制是蛋白结合介导的溶质载体家族2(促进葡萄糖转运体)成员1,组蛋白簇1H2bd,细胞周期素B2,MLF1相互作用蛋白诱导的细胞周期;不同的激活机制是蛋白结合介导的细胞周期蛋白E1,Wolf-Hirschhorn综合征候选基因1,垂体肿瘤转化3,苯并咪唑出芽非抑制1同系物(酵母),精子相关抗原4诱导的细胞周期;相同的抑制机制是整合膜介导的富含亮氨酸的含有重复的G蛋白偶联受体4诱导的G蛋白偶联受体蛋白质的信号通路;不同的抑制机制是整合膜介导的ATP结合盒亚家族C(CFTR/MRP)成员3,铜蓝蛋白(亚铁),核前层蛋白识别因子,UDP-N-乙酰基-α-D-半乳糖:多肽半乳糖胺-T10,DPY-19-样1(线虫),LIM结构域激酶1诱导的信号转导。采用SAM、GRNInfer及模糊启发式聚类分析(DAVID),构建了CDH3和CLDN3的上下游分子网络,进一步从CDH3和CLDN3的上下游网络中提取出细胞粘附网络,最后数据挖掘CDH3和CLDN3参与的细胞粘附功能并对其进行分析。我们的实验结果表明CDH3和CLDN3的细胞粘附功能在肺癌的侵蚀过程中是减弱的。