制定水环境综合区划对于加强我国水环境分区管理具有重要的作用。我国现有的水环境功能区划和水功能区划缺乏陆域生态系统物质循环对水域环境质量影响的综合考虑，很难对陆域生态系统的非点源污染等进行有效管理与控制。因此，现阶段制定水环境综合区划，综合分析和考虑陆域水域、上游下游、区划管理单元与水生态系统过程相互影响相互作用，提出水环境分区管理的新思路，对于提高我国水环境管理水平具有十分重要的意义。 本文研究探讨了水环境综合区划的概念、内涵和区划方法，确定了区划的基本单元和区划指标体系。在综合考虑陆域生态系统、水体生态系统和社会经济系统对流域水环境质量的影响，按照3个子系统确定了影响水环境的主要因素，建立了水环境综合区划的指标体系。在指标体系评价的基础上，按照主导因素法和空间叠置法，确定了小江流域的水环境综合区划方案。依据区划方案，明确了不同区域面临的水环境问题，并提出相应的水环境保护的主要目标和对策措施。 本文对流域水环境综合区划的方法体系进行了理论探讨与应用研究，所采用的方法和得出的结论可为其他流域水环境分区管理提供参考。