胶质瘤靶向干扰miRNa-pathway网络构建和功能模块识别

来源 :哈尔滨医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:wyzhen
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本文对胶质瘤靶向干扰miRNA--pathway网络构建和功能模块识别进行了研究。目前以miRNA为靶点应用于胶质瘤和其他人类疾病的治疗受到越来越多的关注。但是阐述靶向干扰某个分子标记物进而起到治疗作用的过程中,miRNA对细胞中各生物通路发挥的调控机制仍然是一个挑战。本研究在体外对胶质瘤中的六个分子标记物分别进行了有抑癌作用的靶向干扰:miR-181d,-23b,-21以及β-catenin,CBP,STAT3,然后用高通量测序方法检测了干扰前后细胞中miRNA和mRNA的表达谱。基于差异表达的miRNA和mRNA我们采用了一种整合的方法识别出每种分子靶向干扰后发挥主要调控作用的miRNA-pathway调控网络(MPRN),结果发现靶向干扰miRNA或者转录因子都能够影响细胞中miRNA的表达,而这些差异表达的miRNA能够协同的调控关键的生物学通路。通过比较不同干扰条件下发挥主要调控作用的MPRN之间的功能关联,我们发现不同的分子靶向干扰条件所激活的MPRN之间存在交叉对话,并且被多种干扰条件同时激活的MPRN在调控网络的信息传递中占据了核心的位置。因此,根据MPRN对不同干扰条件的响应频率,我们识别出一个包含14个miRNA和5个生物通路的核心调控模块,并证实发挥调控作用的miRNA和通路中的效应基因能够预测胶质瘤病人的预后生存风险,是胶质瘤潜在的治疗靶点。我们的工作为阐述miRNA在分子靶向治疗中发挥的生物学调控机制提供了新的视角,并能够为基于miRNA的胶质瘤治疗药物的开发能够更多的启发。
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