医疗保障是人类生存和发展的重要安全网，关系到社会的稳定以及国家的发展。2003年以来，国家高度重视医疗卫生体制改革，加大了医疗卫生事业的投入，加快了推进新型农村合作医疗和城镇居民基本医疗保险制度建设的步伐，在制度体系上基本实现了国民医疗保障的全覆盖，新型农村合作医疗制度也取得了一定的成效。但是也客观存在一些影响其可持续发展的弊端，而且我国现有的各种医疗保障制度还未能有效覆盖全体居民，是造成“看病难、看病贵”问题的重要原因之一。随着人民对医疗保障的需求进一步提升以及全民医保目标的提出，新型农村合作医疗纳入全民基本医疗保险成为必然趋势，因此，采取怎样的路径将新型农村合作医疗纳入全民基本医疗保险成为关键。本文以探索新型农村合作医疗纳入全民基本医疗保险制度的路径为目标，运用社会正义理论、制度变迁理论、社会保障理论等相关理论工具，首先分析了新农合纳入全民基本医疗保险的必要性和可行性，汲取了全民医保的国际经验，并且以国内高邮、昆山、东莞、镇江以及神木这五个地区的典型模式为例，结合实地调研数据对五种现行路径进行综合比较研究，并得出借鉴性的经验与启示，从而指导新型农村合作医疗纳入全民基本医疗保险的路径选择。最后基于底线公平的视角提出新型农村合作医疗纳入全民基本医疗保险的渐进变迁之路，首先完成新型农村合作医疗制度与城镇居民医保的制度整合，在此基础上进一步完善城乡居民医保，在时机成熟之际完成城乡居民医保与城镇职工的制度整合。其中需强化政府的责任，主要体现在扩大医疗保障范围、扩大医疗保障覆盖面、缩短城乡差距、提高管理科学性、促进卫生公平。