致泌尿道感染的菌群分布、大肠埃希菌耐药性分析及其基因型初步研究

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研究背景自1983年德国报道了首例产超广谱β-内酰胺酶(extended spectrum beta-lactamase,ESBLs)菌株以来,产ESBLs细菌的流行在世界各地被广泛报道[1、2]。全世界许多地方不断有新的ESBLs检出,不到20年的时间,ESBL种类已超过150种。ESBLs是由质粒介导的能赋予细菌对多种β-内酰胺类抗生素耐药的一类酶,它主要由革兰阴性杆菌产生[3]。目前ESBLs主要分5类:TEM型、SHV型、CTX-M型、OXA型及其它。它主要由肠杆菌科的细菌产生,尤其是以肺炎克雷伯菌和大肠埃希菌为代表[3],它的产生是革兰阴性杆菌对β-内酰胺类抗生素耐药的重要原因。产ESBLs的菌株耐药问题已经成为当前全球最重要的医院内耐药问题之一。而且目前产ESBLs细菌在临床标本的分离率还在逐年增加,尤其是随着CTX-M酶分布日渐广泛,对该酶的研究已成为细菌耐药机制研究的新热点。而泌尿系统感染(urinary tract infection,UTI)主要致病菌为革兰氏阴性肠道杆菌,而最常见的引起UTI的致病菌是大肠埃希菌,约占70%以上,其它有变形杆菌,克雷白菌属、铜绿假单胞菌等[4]。随着时间的推移和抗菌药物的广泛使用,大肠埃希菌的耐药性大幅度上升,多重耐药菌株剧增,耐药谱增宽[5]。早期检测ESBLs,对控制其流行和传播,尤为重要。而且,由于每年各地区流行的基因型不同而存在耐药性和检测底物的差别。因此,了解导致泌尿系感染的大肠埃希氏菌的最佳检测底物及耐药性特点,有利于防止产ESBLs菌株的区域性流行,指导临床尿路感染的治疗,以免延误病情和造成浪费。随着抗生素的广泛使用,细菌的耐药性及ESBLs的产生情况每年均会发生变化,通过对我院2008年尿路感染患者中段尿中菌群分布及主要致病菌耐药特点的调查分析,了解目前本地区尿路感染细菌耐药谱情况,并进一步了解泌尿系感染分离的大肠埃希氏菌的耐药性、ESBLs的产生情况及对产ESBLs菌株的耐药性进行研究,并对产ESBLs的大肠埃希氏菌进行耐药基因的初步分型。目的了解我院产ESBLs的导致泌尿系感染的大肠埃希氏菌的最佳底物。调查我院2008年尿路感染患者尿中细菌分布及主要致病菌大肠埃希氏菌的流行情况及耐药性。了解我院产ESBLs的导致泌尿系感染的大肠埃希氏菌的β-内酰胺酶基因型的初步分型情况。提出对我院产ESBLs的导致泌尿系感染的大肠埃希氏菌感染的控制对策。材料与方法收集我院2008年1月至2008年12月临床确诊为尿路感染的门诊及住院患者的分离菌株,采用全自动微生物分析仪(MicroScan WalkAway)对所收集的菌株进行重新鉴定,并采用MH培养基,依据全国临床检验操作规程,K—B纸片法药敏试验,同时进行ESBLs表形初筛及确证试验检测ESBLs菌株。根据GenBank的基因序列设计TEM、SHV、CTX-M、OXA共9对引物,分别对临床分离的导致尿路感染的大肠埃希菌进行PCR扩增。结果我院2008年1月至2008年12月临床确诊为尿路感染的门诊及住院患者,清洁中段尿培养结果以大肠埃希菌分离率最高,为336例患者,占分离菌株的36.29%(336/926),其次为葡萄球菌属及真菌,分别占分离菌株的14.47%和8.96%。大肠埃希菌对亚胺培南、哌拉西林/三唑巴坦、阿米卡星、替卡西林/棒酸、阿莫西林/棒酸和头孢西丁耐药率较低分别为0.9%、5.4%、7.1%、9.8%、10.7%和14.3%,而其他常用抗生素的耐药率均高于50%。336株大肠埃希菌中ESBLS(+)细菌为192株,占57.14%。ESBLS(+)细菌对头孢类抗生素的耐药率普遍高于ESBLs(-)细菌(P﹤0.025)。PCR扩增基因型结果显示大肠埃希菌中CTX-M型219株(发生率为65.2%)、TEM型54株(发生率为16.1%)、SHV型3株(发生率为0.9%)、OXA型9株(发生率为2.7%)、AmpC型3株(发生率为0.9%)。所有耐药菌均可通过质粒转移方式传递其耐药性。结论尿路感染的主要致病菌为大肠埃希菌,其对临床常用20种药物的耐药性率较高,临床医生应当根据药敏试验来选择抗生素,指导临床抗感染治疗。本院导致尿路感染的大肠埃希菌中ESBLs的产生率高、流行广,大肠埃希菌的检出率为36.29%,头孢噻肟检测ESBLs的敏感性明显高于头孢他啶。产ESBLs大肠埃希菌呈多重耐药,治疗中建议首选酶抑制剂以及碳青霉烯类药物(亚胺培南)。导致尿路感染的大肠埃希菌ESBLs基因型以CTX-M型为主,CTX-M型ESBLs基因主要为CTX-M-14型,同时伴有CTX-M-1和CTX-M-8的流行。有些菌株同时携带两种或两种以上耐药基因。
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