耐甲氧西林金黄色葡萄球菌是医院感染的重要病原菌，感染的发病率和死亡率都很高。在过去的20年里应用于流行病监测的各种分子分型方法不断涌现。本研究中，我们首先对新报道的方法，基于SmaⅠ酶切位点的多重PCR分型(SMT)进行了性能评估。其次我们对传统MLVF分型方法进行了改良（命名为CGE/MLVF），并对其进行验证。测试用MRSA菌株分两部分。一部分是来自不同地区有着不同遗传背景但各方面信息明确的参考菌株共42株。另一部分是116株2009年-2010年收集的中国东北三省六家三甲医院的医院流行MRSA菌株。首先对SMT的分辨率及与其他方法的一致性进行了评估。其次对CGE/MLVF与spa分型、MLST/SCCmec分型、传统MLVF分型、PFGE分型的分辨率及分型一致性进行了检测。分辨率以Simpson多样性指数为指标得出SMT,CGE/MLVF,traditional MLVF,spa typing,MLST/SCCmec和PFGE的结果分别为0.517（8个型），0.855(28个型)，0.855(28个谱型)，0.623(11个型)，0.517（8个型）和0.854(28个谱型)。SMT与MLST/SCCmec一致性非常好。CGE/MLVF在分型重复性和准确性方面优于传统MLVF和PFGE分型。对CGE/MLVF的性能验证发现，所有分型方法在分群水平上显示了良好的总体一致性。此外，CGE/MLVF还具备提供可比对、明确的分型结果的可能性。总之，SMT因为其成本低操作简便及与MLST/SCCmec很好的一致性有可能成为常规实验室替代MLST/SCCmec的分型方法。CGE/MLVF潜力更大，快速、简便、低成本、优质的重复性和高分辨率使其有能力成为监测MRSA流行传播的分子分型常用方法。