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海洋覆盖了地球面积的70%以上,其中深海环境占地球表面积的49%,是地球表面最大的生物栖息场所。深海微生物处于高压力、无光照、贫营养、厌氧、极端低温(pH梯度,温度高的地区,如热液喷口部分)、高度的盐浓度含量、高的金属浓度和其他的特殊极端环境中,鉴于其生态环境的特殊性,决定了深海微生物相比于陆生微生物具有极为特异的代谢途径和生物结构。在深海中,最典型的环境因素为低温(2-4℃)及高压(平均380大气压)。为生活在这样的极端环境,深海细菌必然发展出与之相应的分子基础,包括各种代谢途径的调节、物质的转运、生物大分子结构的改变和膜结构的改变等等。本文以深海革兰氏阳性菌株Microbacterium sediminis YLB-01为模型,通过模拟深海环境培养条件(低温、高压),利用转录组和蛋白质组技术分析其差异表达的基因及蛋白质,并结合基因组分析,尝试回答Microbacterium sediminis YLB-01对深海中低温和高压因素的适应性分子基础。Microbacterium sediminis YLB-01的基因组精细图测序表明该菌全长2,760,011bp, G+C%含量为71.88%。使用GeneMarkS软件进行编码基因预测,预测到2,630个编码基因,其中编码区域长度占基因组的比例为91.78%。使用软件IslandPath-DIOMB预测到有2个基因岛。基因岛可以编码多种功能,具有提高生物的适应性等作用。通过软件PHAST显示YLB-01含有1个prophage。前噬菌体具有增强对环境的适应性,提高粘附力等功能。基因组预测结果显示YLB-01含有5个可疑的CRISPR个数。从物种间的进化关系图中可知,海洋来源的2株微杆菌比陆源的3株微杆菌在进化关系上更为原始,与3株陆源微杆菌的祖先可能在同一进化关系。转录组分析结果显示,高表达的lipoprotein涉及的KEGG代谢通路为Peptidoglycan biosynthesis:mts:MTES3232,涉及到细胞壁的合成;ribosomal protein L30涉及的KEGG代谢通路为Ribosome:mts:MTES0907,与核糖体的结构稳定性有关;phosphate ABC transporter ATP-binding protein涉及的KEGG代谢通路为ABC transporters:mts:MTES2452,参与了物质的转运和离子的运输。蛋白质组学质谱分析结果显示,19个差异蛋白点中有14个可信蛋白点。分别与细菌细胞壁的合成、生物大分子的合成、物质转运或跨质膜运输、基因的转录调控、嘧啶核苷酸的合成代谢、核糖体结构的稳定相关。