改革开放以来，我国的区域经济快速发展，但是随着社会主义市场经济体制的逐步完善和地方政府独立利益的日渐扩大，在区域经济发展中出现了比较严重的行政区经济冲突现象，影响了全国统一大市场的形成和区域经济的快速发展。为了解决行政区经济冲突问题，必须加大地方政府间合作协调的力度，通过地方政府间密切合作和有效协调来消除区域经济发展中存在的“行政区经济”现象，实现区域经济的协调发展和可持续发展。 本文针对区域经济发展中存在的区域内产业结构严重趋同、基础设施重复建设、招商引资恶性竞争、公共事务治理失灵和地方保护主义盛行等问题，运用制度经济经济学和博弈论等知识进行了分析，发现地方政府间竞争激烈和合作的欠缺是造成这些问题的主要原因。尽管各级政府为了解决这些问题采取了很多政策措施，但是当前解决这些问题的政策措施存在着不足，难以有效地化解这些冲突和矛盾。在借鉴国外区域经济发展中地方政府间合作经验的基础上，本文提出了实行区域内地方政府间行政一体化的地方政府间关系体制创新。 地方政府间行政一体化是通过融合行政权利来有效协调区域经济发展的地方政府间合作机制。本文对地方政府间行政一体化促进区域经济快速发展的重要作用进行了深入分析，设计了地方政府间行政一体化实施的模式，对行政一体化中可能出现的问题进行了分析，提出了相应对策，并以长三角区域为例，阐述了地方政府间行政一体化对长三角区域经济发展中相关问题的解决思路。