稳定抑制组蛋白去乙酰化酶(HDAC1)的BCBL1细胞系的构建及KSHV乙酰化修饰位点初步研究

来源 :暨南大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:fenjinzhu
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
背景:卡波氏肉瘤相关疱疹病毒(KSHV)是多种致命性淋巴瘤诸如原发性渗出性淋巴瘤(PEL)和多中心卡斯特曼病的致病因子,在感染细胞后,KSHV的生命周期分为潜伏感染期(Latency)和裂解复制期(Lytic replication)。类似于HIV彻底治疗,根除KSHV的关键是将潜伏状态下的KSHV激活转向裂解复制状态。表观遗传修饰是激活KSHV裂解复制的重要方式之一。抑制宿主组蛋白去乙酰化酶(HDAC1)能够增强KSHV基因组的复制。但是目前对于HDAC1抑制后的KSHV基因组上乙酰化修饰机制仍不清除。本研究构建了稳定抑制去乙酰化酶(HDAC1)的KSHV感染的B细胞淋巴瘤(BCBL1),并对KSHV乙酰化修饰位点进行了初步研究。目的:利用CRISPR/Cas9构建稳定抑制HDAC1表达的BCBL1细胞系;阐明HDAC1敲除后对KSHV基因的影响;染色质免疫共沉淀(ChIP)研究HDAC1敲除后KSHV基因组上被乙酰化修饰的位点。方法:1.构建针对人类HDAC1的sgRNA的慢病毒表达质粒LentiCRISPRv2-sgHDAC1,并将构建质粒与慢病毒包装质粒共转染293T细胞,包装LentiCRIPSRv2-sgHDAC1的慢病毒;2.慢病毒感染BCBL1细胞,并使用嘌呤霉素筛选构建的细胞系。使用Western Blotting检测构建细胞系的HDAC1蛋白表达水平以及组蛋白乙酰化水平;使用实时定量荧光PCR检测构建细胞系中HDAC1的mRNA水平以及KSHV裂解期及潜伏期基因的表达;3.摸索ChIP中超声波破碎的条件;4.进行ChIP并验证免疫沉淀效果;并通过ChIP-qPCR技术对DNA进行初步分析乙酰化作用位点。结果:1.构建3组LentiCRISPRv2-sgHDAC1表达质粒,并包装慢病毒;2.筛选感染的BCBL1细胞,Western Blotting检测结果显示HDAC1的表达水平明显降低80%;同时KSHV基因表达水平显著上升;3.探索ChIP实验的条件,初步完成ChIP试验;4.利用ChIP-qPCR技术初步得知KSHV基因组上乙酰化修饰的位点。结论:1.筛选出两株HDAC1表达水平显著降低的BCBL1细胞系;2.研究发现筛选的BCBL1中HDAC1表达水平显著下降,而KSHV裂解相关基因RTA、K8等表达水平显著上升;3.研究发现筛选的BCBL1中HDAC1表达水平显著下降,而KSHV基因RTA、K7乙酰化修饰水平上升,可能是KSHV表观遗传修饰位点。
其他文献
目的探讨糖皮质激素治疗的结节病患者疾病复发率及复发相关危险因素。方法回顾性分析病理确诊的接受糖皮质激素治疗的肺结节病患者临床特征、影像学分期、肺功能检查和治疗信
在电法勘探中,发送机的设计使用直接决定了勘探的效果。其中有一种基于伪随机信号所设计的相关辨识发送机,因为伪随机信号的特性,拥有着广泛的应用前景,然而对于这款发送机的研制目前还存在某些问题。首先,相关辨识的理论研究还在完善,基于相关辨识法的发送机设计还存在不足;其次,现有的发送机硬件系统还存在一些问题,比如控制系统与功率转换模块的分离导致设备体积过大、价格昂贵等;最后,还没有发送机系统结合如今的网络
目的:探析妇科恶性肿瘤合并水肿患者的临床用药规律。材料与方法:通过对临床资料进行回顾分析,按照标准,收集病例合计50例,对其中药处方中的中药饮片进行频数统计并分类分析,
超连续光谱因其超宽的连续光谱范围、高度相干等特性,广泛应用于很多领域,成为光学相干层析技术的首选光源,可有效解决超高速率、超大容量组合复用型光纤传输系统的光源问题。光子晶体光纤以其周期性的包层结构、灵活调节的色散和高非线性等特性,在产生高品质超连续光谱的介质中具有独特优势,而少模光子晶体光纤的模式特性有利于产生更宽的超连续光谱,因此研究少模光子晶体光纤产生超连续光谱,具有重要的学术和应用价值。本文
背景神经退行性疾病(Neurodegenerative disease,NDD)是一类由神经元变性、死亡引起的疾病,与年龄密切相关。随着人口老龄化的发展,神经退行性疾病的发病率逐渐上升,已成为重
相对于地表水库,地下水库因为其具有的众多优点而受到越来越多的关注。我国西南岩溶地区广泛发育的岩溶地貌所衍生出的丰富的岩溶介质使得当地地下水的储存空间、调蓄能力方面具有很大潜力。开展喀斯特“地下水库”对地表水库调蓄能力的研究具有广泛的科学和社会意义。本论文选择位于黔中地区三岔河流域的水城地区作为研究区,旨在定量评价该地地下水库库容(蓄存能力),从而为三岔河流域调蓄水资源提供参考。本文在搜集了大量钻孔
目的:通过观察益水疏木饮治疗肾虚肝郁型女性迟发型青春期后痤疮的临床疗效,初步探讨益水疏木饮治疗女性迟发型青春期后痤疮的安全性及作用机理。方法:采用随机、对照的方法,
第一部分:选择性抑制PI3K介导肺结节病小鼠模型Th1/Th17/Treg再平衡的研究背景:结节病是一种病因不明的多系统免疫性疾病,病理表现为不同器官内非干酪样肉芽肿,主要累及肺。
固有无序蛋白质(Intrinsic disordered proteins,IDPs)是指缺乏特定的三维结构的蛋白质,其折叠结构随环境或配体的变化而变化。在生命体中,特别是真核生物中广泛存在着固有无
目的通过回顾性病例分析,了解西藏高原地区急性ST段抬高型心肌梗死(STEMI)患者的临床特点、危险分层及住院期间转归相关性危险因素,进一步改善STEMI患者近期预后,为本地区STE