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本研究以地方品种固始鸡和快大型肉鸡安卡鸡按F2设计方案进行杂交得到的资源群体为实验素材,通过PCR-SSCP、DNA测序、PCR-RFLP技术在试验群体中对鸡△-9脂肪酸脱氢酶基因序列进行SNP位点的筛选,并研究了△-9脂肪酸脱氢酶基因的多态性与生长性状、肉质性状、屠宰性状、肌肉性状、血液生化指标、脂肪性状、脂肪酸含量的相关关系。1、通过PCR-SSCP和DNA测序对Δ9-脂肪酸脱氢酶基因进行SNP扫描,并对出现不同条带个体进行测序,发现内含子1、外显子2、4具有多态,外显子1、3、6无多态,外显子5引物扩增结果较差。通过测序结果表明,在△-9脂肪酸脱氢酶基因的CDS区域检测到3个SNP,为g.C138T(内含子1),g.A3728G(外显子2),g.G12904A(外显子4),均为同义突变;内含子1出现三种基因型CC、CT、TT,外显子2出现三种基因型AA、AG、GG,外显子4出现三种基因型GG、GA、AA。群体遗传学表明:4个突变位点的多态信息含量(PIC)均为中度多态位点(0.25-0. 5)。2、通过相关性分析,结果显示:△-9脂肪酸脱氢酶基因SNP位点对资源群部分生长性状有显著影响。其中内含子1突变位点对第4周胫长和第12周胸角有显著影响,外显子4突变位点对8周盆骨宽、8周胸骨长、8周胸角有显著影响。△-9脂肪酸脱氢酶基因SNP位点与资源群部分肉质性状的相关性。内含子1突变位点对肌间脂宽、皮脂、皮脂率有显著影响,外显子2突变位点对腿肌失水率、肌间脂宽、皮脂重、皮脂率有显著影响,外显子4突变位点对腿肌PH影响很大。△-9脂肪酸脱氢酶基因SNP位点对资源群部分肌纤维性状有影响。内含子1突变位点对腿肌肌纤维宽度、腿肌肌纤维周长有显著影响。△-9脂肪酸脱氢酶基因SNP位点对资源群部分屠宰性状有显著影响。内含子1突变位点对爪重率、肌胃重率有显著影响;外显子2突变位点对活重、屠体重、屠体重率、半净膛率、全净膛重、头重、全净膛率、肌胃重率、肌胃重有显著影响;外显子4突变位点对半净膛率、胸肌重、屠体重率、全净膛率、胰腺重有显著影响。△-9脂肪酸脱氢酶基因SNP位点对资源群部分血清生化指标有显著影响。△-9脂肪酸脱氢酶基因内含子1突变位点对低密度脂蛋白有显著影响,外显子2突变位点对肌酸磷酸激酶、乳酸脱氢酶有显著影响,外显子4突变位点对碱性磷酸酶、胆碱脂酶、总胆固醇、乳酸脱氢酶有显著影响。△-9脂肪酸脱氢酶基因SNP位点对资源群部分脂肪性状有显著影响。△-9脂肪酸脱氢酶基因内含子1突变位点对肌间脂宽、皮脂重、皮脂率有显著影响;△-9脂肪酸脱氢酶基因外显子2突变位点肌间脂宽、皮脂重、皮脂率有显著影响;外显子4突变位点对心脏重、心脏重率有显著影响。△-9脂肪酸脱氢酶基因SNP位点对资源群部分脂肪酸含量有显著影响。△-9脂肪酸脱氢酶基因内含子1突变位点对C12:0、C14:0、C15:0、C16:0、C16:1、C18:1、C20:2、C22:6含量有显著影响;外显子4突变位点对C16:2含量有显著影响。