产业技术创新战略联盟是两个或两个以上具有独立法人地位的企业及其他组织为了为满足国家战略目标或区域重点产业发展需求,以产业技术进步为目标,在政府的引导下,充分运用市场机制,通过各种长期契约结成的利益共享、风险共担、要素水平式双向或多向流动的松散网络型组织体。对于产业技术创新战略联盟运行机制的理论研究较多,但是应用研究不足。本文首先将产业技术创新战略联盟与战略联盟、产学研合作进行了比较,提出了产业技术创新战略联盟的定义及其结构特征,为运行机制研究打下理论基础。然后根据石家庄市现状,提出了石家庄产业技术创新战略联盟的运行机制。重点研究了石家庄市医药产业技术创新战略联盟成员选择机制,根据制造企业和科研院所两类不同的成员的特点分别建立成员选择模型；研究了资源投入机制,建立了资源价值评估模型,为利益分配奠定基础；研究了利益协调机制,建立了利益分配模型和利益协调模型。实证分析以抗生素产业技术创新战略联盟为研究对象,对其现存的主要问题进行描述,之后从成员选择、利益协调、退出流程优化三个方面展开讨论,为抗生素产业技术创新战略联盟运行机制优化指明方向。最后,提出了对策建议,为政府和产业界进一步发展产业技术创新战略联盟提供参考。