论文部分内容阅读
γ-氨基丁酸受体(γ-aminobutyric acid receptor)属于配体门控离子通道蛋白,广泛分布于神经系统,是药物作用的重要靶标之一。在农药研发方面,γ-氨基丁酸受体是杀虫剂的研究热点之一,其中尤以A型γ-氨基丁酸受体为主。氟虫腈和IBIPPS是作用于γ-氨基丁酸受体的杀虫剂。本论文目的为找出氟虫腈和IBIPPS对线虫的杀虫机理;另外找出氟虫腈对斑马鱼的毒性机理。本论文利用蛋白质同源模建的方法,构建了秀丽隐杆线虫A型γ-氨基丁酸受体和斑马鱼A型γ-氨基丁酸受体,通过分子对接研究秀丽隐杆线虫与氟虫腈和IBIPPS的作用机理;同时将苯基吡唑类化合物与斑马鱼A型γ-氨基丁酸受体对接,希望发现苯基吡唑类化合物与斑马鱼A型γ-氨基丁酸受体结合的主要因素,同时也是为设计高效低毒的苯基吡唑类化合物提供实验数据。主要研究内容如下:1.本论文以秀丽隐杆线虫(Caenorhabditis elegans)谷氨酸受体(PDB登记号3RHW,3.6)作为模板,用同源模建的方法,构建了秀丽隐杆线虫A型γ-氨基丁酸受体和斑马鱼A型γ-氨基丁酸受体的跨膜段。然后利用分子动力学以及拉式图验证了这两个模型的构象稳定性和合理性。2.将氟虫腈和IBIPPS与秀丽隐杆线虫γ-氨基丁酸受体跨膜段进行分子对接,研究氟虫腈和IBIPPS与秀丽隐杆线虫γ-氨基丁酸受体的作用机理和结合模式。发现氟虫腈和IBIPPS与秀丽隐杆线虫A型γ-氨基丁酸受体结合从构象和能量上看都是稳定结合的,秀丽隐杆线虫A型γ-氨基丁酸受体TM2区域的45和49位苏氨酸是对接中起作用的重要氨基酸残基。此外,氟虫腈和IBIPPS都是垂直地定位于跨膜段的胞质端,结合模式相似,IBIPPS与受体结合比氟虫腈与受体的结合更为稳定。3.对各个取代基进行取代得到46个苯基吡唑类化合物与斑马鱼A型γ-氨基丁酸受体跨膜段进行分子对接,通过对对接打分、结合模式和结合自由能的研究,发现苯环上的取代基CF3,Cl,Cl和吡唑环上取代基SOCF3或SO2CF3是产生毒性作用的重要基团。4.在NCI-2000数据库中,筛选了25个与氟虫腈结构有80%相似性的化合物,将筛选得到的化合物与斑马鱼GABAA受体分子对接,分析对接结果,验证上述第三点结论。此外,通过对氟虫腈与斑马鱼GABAA受体对接结果进行分析,发现斑马鱼GABAA受体亚基TM2区域28位天冬氨酸和38位精氨酸是与苯基吡唑类化合物的取代基产生氢键的重要残基。