近年来，随着我国高等教育改革与发展的深入，高等教育改革和铋新的重点逐步向微观层面深入，高校内部管理体制及其改革趋向也因此而成为理论界所关心的重要问题。虽然有关研究对促进我国高校内部管理体制的改革起了积极作用，但它们都只是有关高校内部管理体制特征、改革目标及改革条件的经验分析或原则分析。中国高校内部管理体制改革发展到今天，迫切需要厘清高等学校治理结构的内在逻辑及变化趋向，从而为新时期高校内部管理体制进一步改革提供理论依据。　　本文将借助新制度经济学、教育经济学的有关理论，采用文献研究、规范研究和历史逻辑分析的方法，对公立高校治理结构的抽象概括——高校所有权安排进行理论分析，构建理论研究框架;进而结合我国高校内部管理体制的改革实践，对我国公立高校的治理结构及其变迁趋向进行经济学分析，从而对我国高校内部管理体制的核心——治理结构的进一步改革提出政策建议。　　论文共分五大部分。第一部分是论文的开篇之论，提出了论文所要研究的问题，指明了研究的方法和理论工具。　　第二部分介绍了主要概念和研究的逻辑假设前提。制度是约束人们行为的一系列规则，按照不同的具体制度在制度结构中的作用、地位的不同，诺斯、威廉姆森等人将制度分为制度环境和制度安排（亦称为治理结构）。本文将以治理结构为研究层次，以公立高等学校治理结构的抽象概括——高校所有权安排为分析起点。在以交易为基本分析单位，以有限理性和机会主义行为倾向为行为假定的逻辑假设前提下，从经济学的角度，论证了高校组织是一系列交易的结果，是契约选择的结果，高校的本质是一系列契约的联结。就这一点来说高校与通常的企业没有本质的区别，高校就是企业组织的一种形式。　　第三部分提出了高校所有权安排的一个理论框架。由于不确定性、信息不完全和有限理性，高校被视为一个人力资本和非人力资本的特别契约，但由于契约具有不完备性，因而也就存在剩余权力，将之界定为高校所有权，即剩余控制权形式的权力。对一个高校契约来说，财产所有权（包括人力资本产权和非人力资本产权）是订立契约的必要前提，高校所有权则是它的真实内容或客体。换句话说，财产所有权是交易的前提，高校所有权是交易的方式和结果。由于高校是一个非营利组织，其所有权安排是给定制度环境下当事人之间博弈的结果。从所有者拥有的合法权利的角度来分析，人力资本所有者和非人力资本所有者共同参与高校所有权分配;而从存在的合法权利的角度来分析，高校所有权安排又可表现为不同的形式。高校所有权的安排的影响因素可抽象为两类:制度环境和谈判力。　　第四部分采用历史逻辑分析的方法，将建国以来我国公立高校的发展分为两个阶段，沿着一条清晰的研究路径:制度环境→产权特征→高校所有权安排→治理结构，结合政治经济体制和高校内部管理体制的改革实践分析了我国公立高校的治理结构及其变迁趋向。指出:从交易费用节约的角度来看，我国公立高校所有权安排的调整及其趋向是有效率的;共同治理结构应是公立高校所有权安排的常态。　　然而我国公立高校的治理结构仍然没有走出计划经济体制下的单边治理结构，具体表现在:治理主体单一化、教师权力薄弱、学生权利缺失、权力过于集中且向上偏移。　　第五部分针对我国公立高校治理结构的弊端提出了一系列政策建议。包括加快政治体制改革、转变政府职能、治理主体多元化、规范行政管理机构、提升学生权力、权力中心适当下移和设立中介组织。