随着医疗卫生体制和财政财务管理体制改革的日益深化,医疗机构的运营环境发生了很大变化,经济活动更加复杂。为此,2010年底卫生部联合财政部修订印发了《医院财务制度》,并于2011年7月1日在公立医院改革试点城市施行。三年来,公立医院新财务制度实施情况如何,政府财政补贴是否到位,医疗服务成本是否得到有效控制,能否从一定程度上解决当前“看病难,看病贵”的状况,能否促进医疗服务价格的科学合理制定。对这些问题的评价均需要对公立医院新财务制度的实施情况进行调研,分析新财务制度对医疗服务价格管理效果的评价研究。本文以南京市某公立医院为研究对象,在深入了解公立医院医疗服务价格和新财务制度研究的基础上,探讨公立医院新财务制度对医疗服务价格管理的具体影响。文章从财务制度的预算管理、成本管理和内部控制管理三个角度,分析新财务制度的变化和对医疗服务价格的利弊影响,得出十二个评价指标,并通过层次分析法对管理效果进行评价研究,分别从指标本身和新旧财务制度进行横向和纵向研究,得出如下结论：新财务制度同旧财务制度相比已经在医疗服务价格制定方面取得了较好的成绩,但从具体指标而言,预算执行效率、成本执行效率、内控体系建立、内控执行效率等仍然不够理想。然后以某公立医院针灸室的医疗服务收支在新旧制度实施前后的结构变化,分析成因,对层次分析法的评价结果进行验证性研究。最后从三个角度提出了以下建议,在预算管理方面：提高预算意识,健全内部结构,建立考核制度；在成本管理方面：提高成本管理意识,健全成本考核管理,提高成本管理效率；在内部控制管理方面：提高全员素质,建全内控环境,建立风险评估体系,加强信息沟通。