基于瑞格列奈晶型I多分子片段模拟与计算化学研究

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分子模拟是在原子水平上建立分子模型,模拟分子的结构,并进一步模拟得出分子体系的各种物理、化学性质。国内外研究者开始用计算机模拟药物分子并进行改造,得到药物性质和结构信息,为传统有机合成药物分子提供导向。而当前对于瑞格列奈的研究还停留在实验阶段,并没有应用分子模拟技术对其进行模拟研究以及红外归属。本文将以瑞格列奈晶型I为模型物,应用Materials Studio对瑞格列奈进行模拟研究。  本研究主要内容包括:⑴采用Dmol3程序对瑞格列奈晶型I的结构和相关性质(振动频率、反应活性及稳定性)进行了理论研究,得到了分子的几何优化构型和各原子上的电荷分布以及前线分子轨道能级。几何构型与电子结构,有很重要的参考价值;计算结果表明,瑞格列奈晶型I分子容易得到电子,且亲电反应最容易发生在六元环和苯环相连的N原子上。这些计算结果对同类药物设计与合成具有一定的指导作用。⑵指纹区的归属是个难点,本文根据振动频率计算,对瑞格列奈晶型I分子做了红外归属,帮助复查药物生产制备过程的质量不可控因素,控制药物质量。⑶单分子模拟时,个别频率的计算结果与实验值之间存在一定差异,因为在实验时分子之间时存在分子间作用力的,而在传统模拟法中没有考虑到分子间作用力。为了完善传统模拟方法,探究了多分子片段模拟法,考虑了分子间作用力,能够很好的改善直接优化单分子时存在的缺陷,有效的提高了红外计算值的精度与准确度,对瑞格列奈晶型I分子进行了红外归属,该方法还可拓展到其他分子进行相似的研究。
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