黄瓜白粉病抗性基因挖掘

来源 :中国农业科学院 | 被引量 : 0次 | 上传用户:heixianshengzhs
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白粉病(powdery mildew)是为害黄瓜的世界性病害之一,常对生产造成严重损失。国内外对于黄瓜白粉病的研究都比较重视,但是由于所使用研究材料的遗传背景、病原菌生理小种以及抗病性鉴定方法等的差异,不同学者的研究结果存在很大差异,已报道的抗病基因定位信息和与抗性的连锁标记尚不能满足分子育种的需要。本研究以抗白粉病的黄瓜自交系‘PI200815’和感病材料‘新泰密刺’选系‘931’为亲本构建F2和F2∶3群体(189个株系),结合人工接种抗病鉴定技术和SSR分子标记技术,对抗白粉病基因进行了遗传分析和QTL定位。同时,利用已完成全基因组重测序的黄瓜核心种质材料,进行了全基因组关联分析,在整个基因组范围内挖掘白粉病抗性基因。具体研究结果如下:  (1)通过对P1、P2、F1、F2群体的抗病性鉴定,发现F2群体中病情指数分布呈连续近似正太分布,推断其白粉病抗性是由多个基因控制的数量性状。  (2)利用基于黄瓜全基因组测序开发的2112对SSR引物,对亲本进行筛选,得到129对具有多态性;利用F2分离群体构建了一张包含129对SSR标记、8个连锁群的黄瓜遗传图谱。该图谱覆盖基因组长度857.9 cM,平均图距6.65cM,每个连锁群均可对应到黄瓜7条染色体。  (3)利用构建的遗传图谱,对F2和F2∶3家系群体进行了三个季节的抗病鉴定和QTL定位分析,共检测到2个QTL位点,分别位于黄瓜1号和6号染色体,命名为pmQTL1.1和pmQTL6.1。其中,pmQTL1.1在三个季节中均被检测到,是一个主效的、稳定的QTL位点,位于标记SSR03860和SSR14445之间,LOD最高达到15.33,表型解释率最高达到37.9%。pmQTL6.1只在一个季节检测到,LOD值仅为3.31,表型解释率为7%,为微效的不稳定的QTL位点。  (4)利用生物信息学,结合基因组序列信息,对pmQTL1.1定位区域进行了基因预测,在标记SSR03860-SSR14445之间的物理距离约为689kb,预测到95个候选基因,包含2个NBS类抗病蛋白,1个控制细胞程序性死亡蛋白,2个逆境调控蛋白。  (5)利用重测序的核心种质,进行了黄瓜白粉病抗性基因的全基因组关联分析,检测到6个可靠镪信号位点:pmG1.1、pmG2.1、pmG4.1、pmG5.1、pmG5.2、pmG5.3,其中pmG2.1、pmG5.2和pmG5.3被重复检测到,pmG1.1、pmG5.2、pmG5.3与前人获得的QTL定位结果相吻合。
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