利用微卫星标记分析不同地理亚群香螺群体的遗传多样性

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香螺(Neptunea cumingi Crosse)属软体动物门(Mollusca)、腹足纲(Gastropoda)、前腮亚纲(Prosobranchia)蛾螺科(Buccinidae)、香螺属(Neptunea),主要分布在黄、渤海海域。虽然国内、外对海洋动物的遗传多样性有较多研究,但国内仍未见有利用微卫星DNA分子标记研究香螺的遗传多样性相关方面的报道。本文采用SSR分子标记方法对黄、渤海海域辽宁地区的旅顺(LS)、东港(DG)、庄河(ZH)、长海(CH)以及山东烟台地区(SD)五个地理亚群野生群体的香螺的遗传多样性和种群遗传结构进行了研究。实验共筛选了33对引物,从中筛选出11对引物可扩增出条带,其中8对多态性相对较好的引物,片段大小为150-375bp之间,3对为单态性。对五个地理亚群的94个个体进行了研究。利用Arlequin3.11软件分析了群体内的遗传变异和群体间的遗传结构,计算不同地理种群的遗传距离,用UPGMA法和NJ法构建了五个群体的系统发生树。每对引物检测出的等位基因数为2-4不等,平均每对引物2.750个。观测杂合度在0.173-0.865。分析时发现,群体总的观测杂合度(Ho=0.594)明显高于期望杂合度值(He=0.5 18),存在杂合度过剩的现象。五个地理亚群野生群体香螺的遗传相似系数在0.858-0.992之间,遗传距离0.008-0.164之间,亚群间具有较大的相似性。由SSR扩增得到的亚群间的Fst在0.006-0.188之间,平均值为0.066,基因流(Nm)在2.239-89.283之间,平均值为25.400。遗传分化指数表明,在不同群体间已产生了遗传分化,但是分化较小。AMOVA分析数据表明亚群间的遗传变异指数为3.334%,个体间的遗传变异指数为95.516%,基因分化主要发生在亚群内,而不是亚群之间。根据所构建的4个SSR-PCR聚类图显示:地理位置相对最远的山东(SD)亚群被分为一支,辽宁的4个亚群聚为了一支。通过比较发现,基因流水平的高低、遗传相似性的程度和亚群之间的地理距离有关,地理位置离的越远的亚群,基因流水平越低,遗传分化指数越高,遗传相似系数越小;相反,地理距离较近的两亚群,基因流水平较高,遗传分化指数越小,遗传相似性越大。
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