脑出血患者外周血血清microRNA表达特点的研究

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前言:  脑出血(intracerebral hemorrhage,ICH)是一种严重危害人类健康的、致死率与致残率极高的疾病,而出血后脑水肿是影响脑出血预后的主要因素之一。微小RNA(microRNA,miR)是一种重要的转录后基因表达调控因子,外周血microRNA可有效反映病灶组织的microRNA表达情况。已知脑水肿的形成机制与水通道蛋白(aquaporin,AQP)等基因有关。本研究采用micmRNA聚合酶链式反应(Polymerase chain reaction panel,PCR)芯片技术测定脑出血患者外周血血清microRNA的表达特点,并通过生物信息学分析技术预测差异表达的microRNA的靶基因,挑选出与AQP等靶基因相关的microRNA,探讨microRNA与脑水肿相关的作用通路,期望为脑出血后灶周水肿的监测和治疗提供理论依据。  对象与方法:  采用病例-对照研究方法,病例组选取首次发作的基底节区高血压性脑出血患者8例,年龄在40-80岁之间,均为汉族人,无血缘关系;病例组按其头CT血肿体积分为大量出血(L)组和小量出血(S)组,其中L组及S组患者各4例,两组均为2名男性和2名女性患者;对照(C)组选取健康人4例,均为汉族,无血缘关系,年龄和性别与病例组相匹配,其中男性2例、女性2例。采集每位研究对象外周静脉血4ml,提取血清,抽提RNA,采用microRNA PCR芯片(miRCURY LNATMUniversal RT microRNA PCR, Ready-to-Use Serum/plasma Focus microRNA PCRPanel V3)技术筛选出差异表达的microRNA,运用统计学方法分析病例组与对照组临床资料的差异性及各组间microRNA表达的差异程度,运用生物信息学软件预测差异表达的microRNA的靶基因、分析靶基因的参与的生物学功能,探讨microRNA与脑水肿相关的作用通路。  结果:  1、病例组与对照组的年龄、性别等均无统计学差异(P>0.05);L组与S组相比,采血时间无统计学差异(p<0.05),血肿体积有统计学差异(P>0.05)。血清样本提取RNA质量符合实验要求,实时荧光定量PCR实验完成顺利。  2、脑出血患者血清microRNA与健康对照组相比呈差异表达,大量出血组与小量出血组合计下调的microRNA共有96种,叠加下调的microRNA共有33种。两组下调最显著的microRNA均为hsa-miR-27a-3p和hsa-miR-205-5p。两组中上调的microRNA在本研究中均无意义。  3、包括hsa-miR-27a-3p在内的多种microRNA的预测靶基因都包括AQP11,hsa-miR-27a-3p与AQP11的预测结合位点良好。基因本体论(Gene Ontology, GO)分析提示,差异表达的microRNA靶基因的生物学功能包括神经干细胞的功能维持、多巴胺能神经元的分化等。hsa-miR-27a-3p可能通过影响靶基因AQP11的表达对脑水肿形成起调控作用。  结论:  1、脑出血患者外周血血清microRNA与健康对照组相比呈差异表达,大量出血组与小量出血组合计下调的microRNA共有96种,两组叠加下调的microRNA共有33种。两组中下调最为显著的microRNA均为hsa-miR-27a-3p和hsa-miR-205-5p。两组中上调的microRNA在本研究中均无意义。  2、hsa-miR-27a-3p可能通过影响靶基因AQP11的表达对脑水肿形成起调控作用。
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