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目的：探讨染色体异常患者生精障碍的原因、相关指标改变、异常核型来源及对后代的影响，为不同类型染色体异常患者提供更准确的遗传咨询；此外，寻找由CNVs引起的生精障碍相关基因，为后续研究奠定理论基础。方法：对2009年9月～2013年12月来吉林大学第一医院因男性不育就诊的精液异常（无精子症、隐匿精子症和少精子症）且同时行染色体核型分析的2411例患者进行研究，排除梗阻性无精子症，检出365例染色体异常，患者年龄20～48岁。问卷收集患者年龄、身高、体重、家族史、既往史及父母生育时年龄等基本信息；医生查体记录患者左右睾丸大小、质地、第二性征发育史等临床信息；召回部分染色体异常的先证者父母及兄弟姐妹行染色体核型分析，并记录其生育情况、孕期不良接触史等家系信息。采用WLJY-9000伟力彩色精子图像分析系统检测精子浓度；采用Diff-Quick染色进行精液生精细胞学分析；采用罗氏2010电化学发光仪检测血清生殖激素水平；采用荧光原位杂交技术（Fluorescent in-situ hybridization, FISH）检测患者精子非整倍体发生情况；利用PCR扩增技术检测Y染色体微缺失及SRY基因；电话随访行染色体检查一年以上的异常患者生育结局。对照组为染色体、精液均正常因女方因素行夫精人工授精（Artificial insemination with husband’s semen,AIH）或体外受精-胚胎移植（In vitro fertilization-embryo transfer, IVF-ET）的已生育男性50例，年龄22~42岁。采用SPSS17.0软件进行统计学分析。另外对13例染色体G显带核型异常的患者行高通量测序，检测到的CNVs通过查阅DGV数据库、OMIM数据库以及PubMed进行分析、讨论。结果：1.2411例精液异常患者中检出365例染色体异常，检出率为15.14%，主要异常类型包括克氏综合征201例，染色体多态62例，染色体易位41例，染色体倒位23例，超雄综合征12例，特殊嵌合型9例，男性性反转综合征7例。2.克氏综合征包括188例无精子症，6例隐匿精子症，7例少精子症；精液生精细胞学分析显示无精子症中有13.05%患者可发现成熟精子；患者与对照组比较，身高、左右睾丸大小、FSH、LH、T及T/LH均存在统计学差异（P<0.05）；仅睾丸大小在不同程度生精障碍组中差异有统计学意义（P<0.05）；核型为47,XXY[10]/46,XY[90]的少精子症患者可自然生育后代；先证者父母染色体核型均正常，且生育患者时的年龄与对照组相比无统计学差异（P>0.05）。3.超雄综合征包括4例无精子症，8例少精子症；精液生精细胞学显示患者可有成熟精子发生；患者与对照组比较，身高及左右睾丸大小存在统计学差异（P<0.05）；年龄、睾丸大小、生殖激素水平在不同程度生精障碍组中差异均无统计学意义（P>0.05）；非整倍体精子率较正常对照无明显升高（P>0.05）；先证者父母染色体核型均正常，且生育患者时的年龄与对照组相比无统计学差异（P>0.05）。4.染色体易位包括罗氏易位13例（无精子症4例，少精子症9例），相互易位28例（无精子症7例，少精子症21例）；精液生精细胞学显示不同易位患者精子发生成熟阻滞的阶段不同；3例无精子症易位患者断裂点均涉及1q21；年龄、睾丸大小、生殖激素水平在不同程度生精障碍组中均无统计学差异（P>0.05）；非整倍体精子率较正常对照无明显升高（P>0.05）；36.4%罗氏易位及11.1%相互易位患者可通过自然生育或卵胞浆内单精子注射（Intracytoplansmic sperm injection, ICSI）获得自己的后代；患者父母之一核型同先证者，且生育患者时的年龄与对照组相比无统计学差异（P>0.05）。5.染色体倒位包括无精子症10例，少精子症13例，以inv(9)发生率最高；生精细胞学分析未见各级生精细胞及精子；患者与对照组比较，睾丸大小及T/LH差异有统计学意义（P<0.05）；年龄、睾丸大小、生殖激素水平在不同程度生精障碍组中差异均无统计学意义（P>0.05）；23.1%的inv(9)患者可通过自然生育或ICSI获得自己的后代；患者父母之一核型同先证者，且生育患者时的年龄与对照组相比无统计学差异（P>0.05）。6.染色体多态包括无精子症34例，少精子症28例；生精细胞学分析可见成熟精子；仅睾丸大小在不同程度生精障碍组中存在统计学差异（P<0.05）；非整倍体精子率较正常对照无明显升高（P>0.05）；Yqh-患者Y染色体微缺失发生率较高（54.55%）；25.0%的多态患者可通过自然生育或ICSI获得自己的后代；患者父母之一核型同先证者，且生育患者时的年龄与对照组相比无统计学差异（P>0.05）。7.男性性反转患者7例均为无精子症，且Y染色体微缺失检测9个STS位点均缺失；生精细胞学分析所有患者均未见各级生精细胞及精子；SRY基因检测6例阳性，1例阴性；与对照组比较，身高、睾丸大小、FSH、LH、T水平及T/LH均存在统计学差异（P<0.05）；患者尚不能通过自然生育或辅助生殖（Assisted reproductive technology,ART）获得自己的后代，但可通过AID助孕；患者父母核型正常，但其生育时年龄高于对照组父母生育时年龄（P<0.05）。8.高通量测序检测出11例染色体结构异常及多态患者存在CNVs，部分CNVs涉及到与生精相关的基因结构或功能改变，如位于2p16.3区ALF，2q13区NPHP1，6p21.32区HLA-DRB1，15q11.2区BCL8，17p12区COX10，MAK，DNEL1，21q22.3区DNMT3L基因。结论：1.克氏综合征及染色体多态患者生精障碍程度与睾丸大小有关，超雄综合征、染色体易位及倒位生精障碍程度与年龄、睾丸大小、生殖激素水平未见相关性。2.超雄综合征、染色体易位、染色体多态患者非整倍体精子率无明显升高，认为不存在染色体间相互效应。3.染色体易位断裂点发生在1q21可能与无精子症的发生有关。4.部分嵌合型克氏综合征、罗氏易位、inv(9)及多态患者可通过自然生育或ICSI生育自己的后代。5.克氏综合征、超雄综合征、男性性反转异常核型通常为新发；染色体易位、倒位及多态异常核型通常由父母之一遗传而来。男性性反转综合征的发生可能与父母高龄有关，其它类型异常与父母高龄未见相关性。6.高通量测序检测到的CNVs可能涉及ALF，NPHP1，HLA-DRB1，BCL8，COX10，MAK，DNEL1，DNMT3L基因结构或功能改变，影响其在睾丸组织中的表达导致生精障碍。