西北地区盐渍土可培养微生物多样性分析及分离菌株Z-2和R-8的多相分类研究

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本文首先介绍了微生物分类学研究概况和考克氏菌属、芽孢杆菌属的分类学研究进展。对中国青海和宁夏地区盐渍土可培养微生物进行了研究,对分离菌株进行了16S rRNA基因序列测定,并进行了微生物多样性分析和多相分类研究。本文首先使用不同的选择性培养基对土样中的可培养微生物进行分离,共获得86株菌株,对其16S rRNA基因序列比对分析和系统发育分析,获得此地区可培养微生物多样性信息。基于16S rRNA基因序列的系统发育分析表明:西北地区盐渍土壤微生物多样性丰富,共获得了7个科,19个属,分别属于厚壁菌门、放线菌门和变形菌门。多数菌株属于芽孢杆菌纲和放线菌纲,其中以芽孢杆菌属为优势菌属。两株编号为Z-2和R-8的菌株与其亲缘关系最近种的16S rRNA基因序列相似性分别为98.41%和98.17%,初步判断为新种并对其进行多相分类研究。研究结果表明,菌株Z-2为革兰氏阳性球菌,菌落颜色呈柠檬黄色。生长温度范围为20-37℃,生长pH范围为5.0-9.0,生长NaCl浓度范围为0-7%(w/v)。主要醌型是MK-8(H2)、MK-7和Mk-9(H2)。磷酸类脂类型为双磷脂酰甘油、磷脂酰甘油和不能确定的磷脂酸。细胞的GC含量为67.23 mol%。菌株Z-2与该属中亲缘关系最近的种Kocuria sediminis FS-11T DNA-DNA同源性为25.37%。菌株R-8为革兰氏阳性杆菌,芽孢圆形,位于细胞中部。菌落呈肉色或者淡橘色,圆形不透明。生长温度范围为2-37℃,生长pH范围为5.0-10.0,生长NaCl浓度范围为0-15%(w/v)。磷酸类脂类型为双磷脂酰甘油、磷脂酰乙醇胺和磷脂酰甘油。主要的脂肪酸组分:iso-C15:0,anteiso-C15:0和C16:1ω7c alcohol。甲基萘醌的主要组分是MK-7。细胞的GC含量为39.78%。菌株R-8与该属中亲缘关系最近的种Bacillus haikouensis C-89T DNA-DNA同源性为22.62%。综合菌株Z-2和R-8的形态学、系统发育学、化学分类、分子分类和生理生化特征的多相分类研究结果,确定菌株Z-2和菌株R-8为新种。菌株Z-2命名为柠檬黄色考克氏菌(Kocuria citrenus sp.nov.),菌株R-8命名为肉色芽孢杆菌(Bacillus carnea sp.nov.)。
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