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随着计算机的发展,计算机技术广泛应用于计算生物学、计算化学、药物分子设计等领域,它从分子水平上研究结构与功能的关系,不受样品制备和测试技术的限制,为科研工作者提供更多的参考和实验指导。本论文通过计算机技术研究抗菌肽Phylloseptin-1,-2,-3的抗菌机理和增效性抗体2Z2对人白细胞介素生物活性的增效机制。1、抗菌肽因为种类繁多,具有广谱杀菌活性,不容易产生抗药性等特点被认为是取代传统抗生素的最佳选择。抗菌肽Phylloseptin-1,-2,-3(PS-1, PS-2, PS-3)是Phylloseptin (PS)家族六个成员中的三个,具有74%的序列同源性,具有广谱的抗菌活性。本论文用分子动力学方法模拟了单个和多个PS-1, PS-2, PS-3分子与POPC中性膜的相互作用,共六个模拟体系。研究发现PS-1, PS-2和PS-3与中性POPC膜存在相互作用,并且三个互为同系物的抗菌肽有相似的动力学抗菌行为,都可以快速的渗透进入膜的磷脂层头部区域；单个肽分子与中性POPC膜作用时,对POPC膜的整体结构没有造成明显的干扰或破坏,但是当肽分子数目增加,肽链之间出现聚集现象,随着聚集的肽链向膜内部渗透,膜的脂双分子层结构出现很明显的扰动或破坏,在膜表面出现磷脂头凹陷的现象,使膜的通透性发生变化,从而起到杀死细菌的作用。2、近年来发现一些增效性抗体,这些抗体与细胞因子特异性结合时,使细胞因子的生物活性增强,目前对它们的增效机制还不是很清楚。本论文运用分子对接技术预测白细胞介素HIL-21与其增效性抗体2Z2的复合物结构,研究增效性抗体2Z2增强HIL-21生物活性的机制。研究发现增效性抗体2Z2和非增效性抗体3B3在HIL-21上的抗原表位是不同的,2Z2在HIL-21上的抗原表位主要集中在HIL-21的B螺旋和CD Loop区,然后通过依次突变结合区的氨基酸或某个氨基酸,观察改变后引起的变化,指导对2Z2增效机制的研究。