圆盘菌科真菌MAT基因结构、进化及其功能的初步研究

来源 :云南大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:leolee
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
生殖是生物最基本的特征之一,是生物适应与进化的基础。生物的生殖包括两种方式,即无性生殖(asexual reproduction)与有性生殖(sexual reproduction)。而在真菌中,由于存在着极其多样化的生殖特征,现在已成为研究的热点,目前有关有性生殖进化和维持机制方面的研究知之甚少,相关物种的生殖模式、发生有性生殖的机制和相关信号通路、诱导有性生殖的内在和环境因素等,也一直是一个悬而未决的问题。因兼具多种生殖模式,圆盘菌科真菌已经成为了研究真菌有性生殖机制的理想模型。在课题组分离和保存了圆盘菌科多种能进行有性生殖模式个体的基础上,本论文拟以交配型基因为靶标,通过对交配型基因的结构、进化和基因功能进行初步研究,旨在为理解圆盘菌科真菌有性生殖的进化和生态适应提供有价值的线索。主要研究结果如下:1.对包括圆盘菌科六个代表属节丛孢属(Arthrobotrys)、小德氏霉属(Drechslerella)、亚隔指孢属(Dactylellina)、隔指孢属(Dactylella)、双头盘菌属(Dicranidion)、圆盘菌属(Orbilia),15株菌进行了全基因组重测序、经组装和分析后注释了所有测序真菌的交配型基因位点(mating type locus),交配型基因大小在1445~4378 bp,编码434~1142个氨基酸,内含子1-7个不等,确认同宗配合真菌两种,异宗配合真菌两种。2.对交配型基因序列进行了种间和种内差异性分析,发现交配型基因一级结构在种内是保守的,在种间随着物种的不同存在显著差异。通过对交配型基因位点的结构分析,发现交配型基因上游相对保守,而下游基因却存在着大量的易位和倒置;并对不同物种交配型基因二级和三级结构进行预测,发现其存在保守的二、三级结构,编码相同的蛋白质家族HMG-domain,即MAT1-2交配型位点的核心蛋白;更进一步的选择压力分析显示,交配型基因受到的选择压力远远大于看家基因,在不同生殖模式中,两种交配型基因受到的选择压力各不相同,MAT1-2基因在同宗配合真菌中受到的选择压力是远远大于异宗配合真菌,MAT1-1基因在不同生殖模式中受到的选择压力相同;基于上述研究结果我们支持“交配型基因MAT1-1是由MAT1-2进化而来”这一假说。系统发育研究展示了交配型基因和核基因具有不同的系统发育树拓扑结构,表明交配型基因和看家基因有着较大程度的分化,极有可能是交配基因受到更大的选择压力影响导致,这种系统发育拓扑结构上的差异在座囊菌纲(Dothideomycetes)和锤舌菌纲(Leotiomycetes)极为明显。3.以A.oligospora为研究对象,基于全国范围内采集的96株菌,分别扩增了 MAT1-1、MAT1-2、ITS、RPB2、β-tub五个基因,其中扩增出 MAT1-1 菌株47株,MA"H-2菌株49株,比例接近1:1,存在有性生殖的可能,并按照MAT1-1和MAT1-2基因的不同将所有菌株分为两个类群,进行了群体遗传学的分析,利用单基因构树和多基因联合构树发现 A.oligospora分为三个支系,与之前的研究相同,存在明显种内分化,单基因和多基因联合构树显示样品的聚类和地理分布关系不大,STRUCTURE分析得知MAT1-1类群分为四个群体结构,而MAT1-2类群分为两个群体结构,整个A.oligospora类群存在种群分化;两个类群群体贡献均为种群内部变异的贡献大于种群间贡献,存在群体间的基因流,连锁不平衡分析和系统发育不相容分析表明,在种群内部存在随机重组,基于上述研究,多证据表明A.oligospoA 种群内部极可能存在有性生殖,随后我们用多种培养基在不同条件下进行了该类真菌有性生殖的诱导,并未成功诱导出其有性生殖结构,通过测序检测也并未发现重组,但是对不同诱导时期的样品提取RNA后进行MAT1-1基因的cDNA扩增,发现该基因的转录,暗示着该类真菌的有性生殖还受到其他多种因素的控制。4.为了进一步的研究交配基因是否参与菌丝的生长、孢子的发育或具备其他生物学功能,我们以尿嘧啶缺陷型酿酒酵母为载体细胞,通过电转的方法成功构建了A.oligosp A 两个交配型基因的敲除载体,并以CaC12-PEG介导的方法成功获得了A.oliospora △MAT1-1敲除株,分别比较了野生型和敲除株的生长速率、抗逆性、孢子形态及数量和产捕器能力,实验结果表明,在生长速率和产捕器能力上野生型和敲除株无明显差异,但是在孢子的形态、数量和抗逆性上具有统计学上意义,表明该基因可能影响着该科真菌的无性生活史。
其他文献
以下是通过行动研究法和文献法对案例进行的分析与研究,提出关于幼儿生成活动及教师的回应策略。一、教育实习中的案例描述 (一)案例背景 2008年10月27日,在尚志幼儿园的中班一内
期刊
干气密封(DGS)因其非接触运行特性,具有摩擦功耗低、使用寿命长和泄漏率低等优势,目前已在旋转机械中得到广泛应用,其中以螺旋槽干气密封(S-DGS)应用最广。随着S-DGS应用范围
[摘要] 目的 分析酒精性肝炎患者肝炎病毒的检验结果。 方法 收集我院2012年3~12月诊断和治疗的酒精性肝炎患者168例,检测AST、ALT、GGT、HBsAg。 结果 酒精性肝炎患者中HBsAg阳性率16.7%。酒精性肝炎合并乙肝病毒感染患者的ALT、AST、GGT水平明显较高。18例有疲惫乏力症状,占64.29%;21例合并食欲不振、腹胀等,占75.00%;15例合并有皮肤、巩膜、尿液变黄
第111届中国进出口交易会(以下简称“广交会”)于5月5日落下帷幕。虽然本届广交会到会采购商超过21万人,创下历史新高,但出口成交额360.3亿美元,环比和同比分别下降4.8%和2.3%,这是自200
对建设工程招投标活动中的串标陪标的行为进行简要分析,在此基础上提出如何防治串标陪标行为的若干对策。
目的比较雷贝拉唑与奥美拉唑治疗反流性食管炎的临床疗效。方法选取在我院诊治的反流性食管炎患者84例,随机分为对照组和研究组。对照组给予奥美拉唑治疗,研究组给予雷贝拉唑
文章介绍了资本成本会计,并以某公司为例。对比了资本成本会计与传统会计计量体系下财务报表的编制,展示了资本成本会计体系对财务报报结构及项目价值的影响。
本文通过课堂观察以及访谈的研究方法,针对本校outlet外教口语课堂中的非英语专业学生的学习风格进行了研究,分三个方面分析了结果并做出总结。