埃博拉病毒(Ebolavirus)是引起人及非人灵长类出血热疾病的一种病原体，对人的致死率更是高达90％，因为其高致病性被列为生物安全四级病原体。埃博拉病毒的不同种之间核苷酸相似度为55％-70％，其核衣壳蛋白(nucleocapsidprotein，NP)相似度更是高达79％，因而存在很强的血清学交叉反应，为血清学调查时病毒感染类型的甄别带来了困难。　　 本文在对埃博拉病毒NP进行大量分析的基础上合成了6个长度为14个氨基酸的短肽和表达纯化了6个多肽，并通过对这些肽段进行一系列的评测和验证从中成功筛选出了扎伊尔埃博拉病毒(Zaire ebolavirus, EBOV)的1个特异性免疫肽段EBOVNP116和雷斯顿埃博拉病毒（Reston ebolavirus，RESTV）的1个特异性免疫肽段RESTVNP100。此外，我们基于筛选出的特异性多肽EBOVNP116和RESTVNP100建立了一套间接酶联免疫测定法和一套双抗原夹心酶联免疫测定法，用于检测病毒的抗体。通过评测显示这两套ELISA可以对蝙蝠、猴子、猪和人等多个物种进行埃博拉病毒的血清学检测和分型。随后，我们利用建立的间接法ELISA对中国南方部分地区蝙蝠中埃博拉病毒流行情况进行了血清学调查。结果显示中国境内长翼蝠和南蝠等多个蝙蝠种群中埃博拉病毒核衣壳蛋白抗体呈现阳性，并且病毒的感染类型更靠近扎伊尔埃博拉病毒。