基于定量蛋白质组学的胃癌预后生物标志物的发现研究

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胃癌,作为全世界发病率第五高同时也是致死率第二高的癌症,是一种高度异质型的疾病。目前临床上通行的胃癌组织分型标准有两种,一种是Lauren于1956年提出的分型系统,它将胃腺癌分成了肠型、弥漫型和混合型;另一种是世界卫生组织WHO于2010年提出的分型系统,它将胃癌分成了乳头状、管状、黏蛋白样和低粘着力型。两种分类系统都使得人们对胃癌的组织形态有了更好的了解,但是在对其预后判断和治疗指导上仍有诸多局限性。  胃癌蛋白质组学层面的变化是肿瘤功能变化最直接的体现,这些蛋白质在调控细胞周期、细胞增殖、细胞分化、代谢和凋亡等各个生物学过程中都有重要的作用。而这些影响细胞过程和功能的蛋白质与胃癌病人的预后有着紧密的联系。选取肠型和弥漫型胃癌以及癌旁样本各14例作为研究材料,结合稳定同位素标记技术(二甲基标记),寻找蛋白质组中与疾病预后密切相关的生物标记物分子。通过控制数据质量和筛选蛋白质假阳性率等指标,在所有的样本中共定量到3885个蚤白质。采用HCA和PCA主成分分析、偏最小二乘法聚类等对不同分型和不同预后癌症样本的蛋白质水平的变化进行分析,并采用David和KEGG pathway对变化显著的蛋白质进行生物学功能注释和通路富集。此外,还采用了Cytoscape软件对差异蛋白质进行相关性网络分析。  分析结果显示,弥漫型相较于肠型胃癌,出现了细胞外基质受体通路的显著富集,同时在相关性网络分析中出现了胶原蛋白聚集的现象。另外通过对弥漫型胃癌未复发与复发样本差异比较,初步确定了9个潜在的生物标志物用于区分其预后,其中6个生物标志物分子亚细胞定位于外泌体部分。同时又检查了该9个标记分子在肠型和混合型(预实验数据)中表达趋势,发现其大部分与在弥漫型胃癌未复发与复发样本中表达趋势相反。后续会通过免疫组化的方式对这9个标志物进行验证,如果能够获得确认,将会在更多的病人人群中进行扩大验证。
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