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浙江省宁波市和磐安县栽培的浙贝母(Fritillaria thunbergii Miq,Thunbergfritillary)植株表现花叶或斑驳症状。用略作修改的常规线状病毒提提方法从病叶中提取出一种线状病毒,经过一系列鉴定,确定为马铃薯Y病毒属的一个新种,暂命名为浙贝母花叶病毒(Thunberg fritillary mosaic virus,TFMV)。 该病毒粒子长约750 nm,直径12-13 nm,略弯曲。病叶细胞质中含有马铃薯Y病毒属成员特异的柱状(风轮状)内含体和长的簿片状聚集体。用SDS-PAGE方法确定该病毒CP的相对分子质量为32 kDa。除浙贝母外,摩擦接种该病毒于17种广泛应用的指示植物均不表现症状。该病毒CP与26种来自5个不同属病毒的CP无血清学关系。Western blot、对流免疫电泳和火箭免疫电泳可以定性检测病叶中的浙贝母花叶病毒,而免疫扩散和ELISA方法不适合该病毒的检测。 分别测定了浙贝母花叶病毒宁波和磐安分离物的基因组全序列。宁波分离物(序列登录号AJ851866)和磐安分离物(序列登录号AJ885005)的基因组均由9723个核苷酸组成(不包括polyA尾),均具有单一开读框。二者全序列高度同源,全序列核苷酸同一性为98.1%,多聚蛋白氨基酸序列同一性为98.0%,可以肯定两个分离物属同一种病毒。计算机分析揭示,二者有相同的基因组结构,开读框均起始于第107-109位的第一个AUG起始密码子,均终止于第9494.9496位UGA终止密码子,均编码一个由3129个氨基酸组成的的多聚蛋白,相对分子质量为354.4 kDa,3’-NTR长224个核苷酸。 TFMV基因组结构具有典型的马铃薯Y病毒属成员的基因组结构特征,它的多聚蛋白裂解位点分别是IKEF/S(P1/HC.Pro)、YRVG/G(HC-Pro/P3)、YIFQ/A(P3/6K 1)、MKFQ/S(6K 1/CI)、LHFQ/S(CI/6K2)、YSFQ/A(6K2/NIa-VPg)、LVFE/S(NIa-VPg/NIa-Pro)、WNFQ/A(NIa-Pro/NIb)和。FCFQ/A(NIb/CP)。推测的CP由269个氨基酸组成,相对分子质量为30.7 kDa,与SDS-PAGE测定的结果相似。 用TFMV基因组全序列与39种其他马铃薯Y病毒属成员的全序列进行同一性比较和系统进化树分析。TFMV与百合斑驳病毒(Lily mottle virus,LMoV)在6K1、VP2和NIb区域最相似,全长多聚蛋白氨基酸序列的BLAST搜索显示LMoV与TFMV关系最近,两者ORF氨基酸序列同一性为53.0%,核苷酸序列同一性为56.7%。全长多聚蛋白氨基酸序列系统进化树分析揭示TFMV与韭葱黄条病毒(Leekyellow stripe virus,LYSV)、LMoV、菜豆黄花叶病毒(Bean yellowmosaic virus,BYMV)和三叶草黄脉病毒(Clover yellow vein virus,ClYVV)具有明显的成簇关系,特别与LYSV成簇明显。LYSV和LMoV同样侵染百合科单子叶球茎植物。 将TFMV与82种马铃薯Y病毒属和黑麦草花叶病毒属成员基因组3’-末端编码序列(部分NIb和全长CP基因)进行系统进化树分析。结果表明TFMV与石蒜轻斑驳病毒(Lycors mild mottle virus,LyMMoV,AF399672)关系较近,二者3’-末端序列核苷酸同一性为69.1%,CP基因核苷酸序列同一性为72.8%。