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茎基腐病是中国小麦生产中一种新发现的由多种镰刀菌引起土传病害,该病害在黄淮麦区发生普遍,并呈现出不断蔓延和加重的趋势,严重威胁小麦生产。本研究分别于2014年5月和2015年5月从黄淮麦区的河南、河北、山西、安徽、江苏和山东等省不同地区进行采样,通过组织分离、形态和分子鉴定,弄清了黄淮麦区小麦茎基腐病的病原种类及优势种。运用ISSR-PCR和URP-PCR技术分析了黄淮麦区小麦茎基腐病优势病原菌假禾谷镰孢(Fusarium pseudograminearum)的遗传多样性,测定了不同地区假禾谷镰孢代表性菌株的致病性,明确了该地区优势病原菌假禾谷镰孢的遗传多样性水平、菌株地理来源及致病力之间的关系。主要研究结果如下:1、从黄淮麦区采集具有小麦茎基腐病症状的病株,通过组织分离、形态鉴定和分子鉴定,结果表明:本地区小麦茎基腐病株的病原分离物为多种镰孢菌,包括假禾谷镰孢(F.pseudograminearum)、禾谷镰孢(F.graminearum)、层出镰孢(F.proliferatum)、木贼镰孢(F.equiseti)、三线镰孢(F.tricinctum)、尖孢镰孢(F.oxysporum)和黄色镰孢(F.culmorum),其优势病原菌为假禾谷镰孢(F.pseudograminearum)和禾谷镰孢(F.graminearum)。假禾谷镰孢(F.pseudograminearum)的总分离频率最高,高达52.31%,禾谷镰孢(F.graminearum)的分离频率仅次于假禾谷镰孢(F.pseudograminearum),为23.59%。各地区小麦茎基腐病的病原菌种类有一定区别,河南北部、河南中部、河北地区以假禾谷镰孢(F.pseudograminearum)为优势病原菌,分离频率分别达到69.89%、58.00%和53.19%;河南南部、河南西部、河南东部、山东和山西地区以假禾谷镰孢(F.pseudograminearum)和禾谷镰孢(F.graminearum)为优势种,二者分离频率均达到21%以上;而江苏和安徽两省则以禾谷镰孢(F.graminearum)为优势种,分离频率分别达到100%和33.33%。2、选用17个ISSR引物对河南和河北冬小麦区的166株假禾谷镰孢(F.pseudograminearum)菌株进行扩增,共扩增出234个DNA片段,其中多态性片段为218个,占93.16%。平均每个引物可以扩增出13.76个条带。Shannon’s信息指数和Nei’s基因多样性指数最高的地区是河南北部地区,最低的地区是河南南部地区。遗传相似性分析表明,河南北部地区和河南东部地区假禾谷镰孢种群的亲源关系最近,河南南部地区和河南东部地区假禾谷镰孢种群的亲源关系最远。6个地理群体间的遗传分化系数(Gst)为0.1571,群体内为0.8429,表明假禾谷镰孢群体内多样性明显大于群体间的多样性。6个地理群体间的居群每代迁移数(Nm)为2.6819,表明来自不同地理地区的假禾谷镰孢菌株间存在较大的基因流动。在遗传相似系数为0.966水平上,6个地理群体可以划分为两大类群。第Ⅰ类群包括五个地区,即河南北部、河南东部、河南中部、河北中部和河南西部地区,第II类群包括河南南部地区。3、选用9个URP引物对来自黄淮麦区不同地区的261株假禾谷镰孢(F.pseudograminearum)菌株进行扩增,共扩增出132条带,多态性条带为128条,占96.97%,平均每个引物扩增出14.67个条带,其中引物UPR9F扩增的条带数最多,达到19条带。8个地理群体间的居群每代迁移数(Nm)为2.8362,表明来自不同地理地区的假禾谷镰孢菌株间存在较大的基因流动。河南中部地区和河南北部地区假禾谷镰孢种群的亲源关系最近;山东地区和河南南部地区假禾谷镰孢种群的亲源关系最远。在遗传相似系数为0.962的水平上,8个地理群体可以划分为两大类群,第Ⅰ类群包括五个地区,即河南北部、河南中部、河南东部、河南西部和河南南部地区,第II类群包括三个地区,即河北、山东和山西地区。4、黄淮麦区不同地理来源的假禾谷镰孢(F.pseudograminearum)代表性菌株的致病力测定结果显示:菌株间致病力差异十分明显,其中致病力最强的菌株为分离自河南北部地区鹤壁市浚县钜桥镇的XX114-9A,其病情指数和发病率分别为91.11和100%,而分离自河南南部地区南阳市方城县城关镇的菌株FC136-2A的致病力最弱,其病情指数和发病率分别只有6.67和25.00%。菌株致病力与地理分布没有明显相关性,不同地区假禾谷镰孢均有一定的致病性,分离自同一地理地区内的假禾谷镰孢菌株间致病力也存在一定的差异。