论文部分内容阅读
本研究以细毛羊754个个体为材料,采用DNA池和第二代重测序技术相结合,测序筛选候选基因FZD3、SFRP4、Notch1和PTPN13的SNPs,同时筛选出可能与毛性状显著相关的SNPs,运用MassArray技术对显著的2个SNPs以及候选基因的9个SNPs进行基因型分型,采用SAS 9.1最小二乘方法分析11个SNPs与毛性状关联性,以期筛选与细毛羊经济性状相关的分子标记,为今后培育细毛羊新品种提供试验依据。主要研究结果如下:1.利用DNA池检测与细毛羊毛性状相关SNPs利用重测序技术对两个极细和极粗的DNA池中筛选出与毛性状相关的SNPs:T19381438G和G19381838T,这两个位点距离ACAN基因120kb处;FZD3基因筛选出32个非同义突变位点,4个同义突变位点,1个密码终止子;Notch1基因筛选出3个非同义突变位点,9个同义突变位点;PTPN13基因筛选出9个非同义突变位点,19个同义突变位点;而SFRP4在编码区只发现1个同义突变位点。2.连锁不平衡分析以及单倍型分析ACAN基因的两个突变位点:T19381438G和G19381838T处于强连锁不平衡状态,D′和r2值分别为:1和1;基因PTPN13中T101275261C和A101276228C突变位点,T101275261C和G101300776突变位点处于连锁不平衡状态,D′和r2值分别为:1和0.326,1和0.469。3.候选基因的多态性检测及其与细毛羊毛性状的关联分析运用SAS 9.1对11个SNPs与毛性状的GLM分析,结果显示,FZD3基因的A101762198T突变位点与剪毛量显著相关(P<0.05),Notch1基因的A2886871G突变位点跟细毛羊的鉴定时体重以及剪毛后体重分别呈显著相关(P<0.05)和极显著相关(P<0.01),A2899358G突变位点跟纤维离散、变异系数和鉴定时体重呈显著相关(P<0.05);PTPN13基因的A101281906C和A101279366G突变位点跟剪毛后体重分别呈显著相关(P<0.05)和极显著相关(P<0.01),A101276228C突变位点和鉴定时体重呈显著相关(P<0.05)。